高企年报的填写步骤如下：
登录国家税务总局网站，进入高新技术企业认定管理系统。根据要求填写相关信息，包括企业基本信息、高新技术企业认定申请信息、年度经营管理情况等。
在高新技术企业认定管理系统中填写年度经营管理情况的信息，包括经营收入、研究开发费用、技术合同、专利等相关情况。
根据要求填写财务报表、审计报告等相关信息，包括企业资产负债表、利润表、现金流量表等。
根据要求填写企业高新技术认定申请表。需要说明企业研发经费、研发人员、研发项目等情况。
在高新技术企业认定管理系统中上传相关资料，包括企业营业执照、组织机构代码证、税务登记证等证照复印件。
完成年报后进行提交。提交后需要等待国家税务总局的审核，审核通过后才能获得高新技术企业认定资格。
具体的高企年报填写流程可能因地区和公司类型等原因而有所不同，因此具体操作前应仔细查看相关规定。