生产企业出口退税申报系统流程如下：
下载出口退税网程序和生产企业出口退税申报系统
打开网站，输入用户名、密码登录。
登录后，点击左侧的“下载专区”，首先在搜索框中输入“1.51”搜索，出现“出口退税网安装程序1.51版”，右键选“使用网际快车下载”，下载此程序后进行安装。
然后下载“生产企业出口退税申报系统”，进行安装（请尽量按默认路径安装）。
进行退税申报系统的系统设置
打开桌面上的“生产企业出口退税申报系统7.0版”，用户名输入sa，密码为空，确定。准备录几月份的出口数据，所属期就输入几月份，例如当前月份200611。
新安装的申报系统，首先要进行企业信息设置。点菜单“系统维护”-“系统配置”-“系统配置设置与修改”，点“修改”按钮，必须修改的内容有：
企业代码：纳税人识别号：退税登记证号：退税登记日期：纳税人类别：计税计算方法：进料计算方法：所有企业该栏录入“2”（购进法）。分类管理代码：税务机关代码：税务机关名称等检查无误后，点“保存”按钮。修改完毕，点“退出”按钮，系统重新进入。
录入退税申报数据
有进料加工业务的企业，备案当月，在退税申报系统中，点“向导”第一步“免抵退明细数据采集”-“进料加工手册登记录入”，点“增加”按钮，录完点“保存”按钮。
料件进口当月，在退税申报系统中，点“向导”第一步“免抵退明细数据采集”-“进口料件明细申报录入”，点“增加”按钮，录完点“保存”按钮。
“向导”第一步“免抵退明细数据采集”-“出口货物明细申报录入”，录入申报期当期发生的且做帐务处理的所有出口明细。（无进料加工的企业从此步做起。）点“增加”按钮，录完点“保存”按钮。
“向导”第一步“免抵退明细数据采集”-“收齐出口单证明细录入”，将前期单证不齐本期做收齐的处理。点“修改”按钮，录完点“保存”按钮。
生成预申报数据
网上预申报和查看预审反馈
读入预审反馈，生成明细申报数据
录入单证备案数据
在申报系统中，点“基础数据采集”-“企业经营情况”-“出口货物单证备案目录录入”，点“增加”按钮，根据相关单证的编号，录入此批出口的单证备案数据。
外贸企业出口退税申报流程操作外贸企业出口退税申报流程操作如下：1、有关证件的送验及登记表的领取；2、退税登记的申报和受理；3、填发出口退税登记证；4、出口退税登记的变更或注销。
出口退税的条件：1、企业必须是出口企业，对外贸易实现货物出口；2、出口货物必须是符合国家出口政策的产品；3、出口货物必须是实物出口，而非服务等其他形式的出口；4、退税金额必须符合国家相关规定的标准；5、企业必须符合国家相关的法律法规和政策；6、企业必须按照国家相关规定的时间和流程进行申请。
综上所述，不同地区和行业的出口退税政策和标准可能有所不同，企业在申请出口退税前，需要详细了解当地和行业的相关政策和要求，并按照规定的时间和流程进行申请。
如果企业出口退税申请不符合相关要求，可能会被税务机关拒绝退税，企业需要认真了解和遵守国家相关规定。
【法律依据】：《中华人民共和国税收征收管理法》第五十一条纳税人超过应纳税额缴纳的税款，税务机关发现后应当立即退还；纳税人自结算缴纳税款之日起三年内发现的，可以向税务机关要求退还多缴的税款并加算银行同期存款利息，税务机关及时查实后应当立即退还；涉及从国库中退库的，依照法律、行政法规有关国库管理的规定退还。
第五十二条因税务机关的责任，致使纳税人、扣缴义务人未缴或者少缴税款的，税务机关在三年内可以要求纳税人、扣缴义务人补缴税款，但是不得加收滞纳金。
扣缴义务人计算错误等失误，未缴或者少缴税款的，税务机关在三年内可以追征税款、滞纳金；有特殊情况的，追征期可以延长到五年。
抗税、骗税的，税务机关追征其未缴或者少缴的税款、滞纳金或者所骗取的税款，不受前款规定期限的限制。
外贸公司出口退税申报流程法律分析：外贸出口退税申报手续为：1、申报资料，出口单位在规定期限内，收齐出口货物退税所需的有关单证，使用国家税务总局认可的出口货物退税电子申报系统生成电子申报数据，如实填写出口货物退税申报表，向税务机关申报办理出H货物退税手续。
预审，出口单位申报出口货物退税时，税务机关及时予以接受并进行初审。
出口退税申报的审核审批，税务机关受理出口单位出口货物退(免)税申报后，在规定的时间内，对申报凭证、资料的合法性、准确性进行审查，并核实申报数据之间的逻辑对应关系。
办理退税，税务机关将出口单位申报的手续齐备、内容真实的资料进行审核无误后办理退税手续。
法律依据：《中华人民共和国税收征收管理法》第十五条 企业，企业在外地设立的分支机构和从事生产、经营的场所，个体工商户和从事生产、经营的事业单位（以下统称从事生产、经营的纳税人）自领取营业执照之日起三十日内，持有关证件，向税务机关申报办理税务登记。
税务机关应当于收到申报的当日办理登记并发给税务登记证件。
工商行政管理机关应当将办理登记注册、核发营业执照的情况，定期向税务机关通报。
本条第一款规定以外的纳税人办理税务登记和扣缴义务人办理扣缴税款登记的范围和办法，由国务院规定。
从事生产、经营的纳税人，税务登记内容发生变化的，自工商行政管理机关办理变更登记之日起三十日内或者在向工商行政管理机关申请办理注销登记之前，持有关证件向税务机关申报办理变更或者注销税务登记。