分支机构的企业所得税由总机构汇总申报缴纳；分支机构不需进行预缴申报总机构应在进行企业所得税汇算清缴时，向主管税务机关报送《企业所得税年度纳税申报表》同时，附送分支机构名单，及各分支机构填写的《企业所得税年度纳税申报表》，（只填写主表1至13行次）一式两份。
总机构主管税务机关审核分支机构汇总申报情况后，将分支机构填写的《企业所得税年度纳税申报表》加盖受理专用章，退还总机构一份，并为其出具《企业所得税汇总申报确认单》（见附件）；
各分支机构应在年度终了后6个月内，将《企业所得税汇总申报确认单》、以及加盖总机构主管税务机关受理专用章《企业所得税年度纳税申报表》，一起报送分支机构主管税务机关；
对年度终了后6个月内，分支机构不能提供上述资料的，分支机构主管税务机关应依据税法规定核实其应税所得，就地征收企业所得税，并按《中华人民共和国税收征管理法》及《实施细则》的有关规定予以处罚。