个人从境内两处或两处以上地方取得薪金或收入，缴纳个人所得税时应合并所有工资，算出应缴税额，再扣除代扣代缴额。纳税人应于每月7日前向税务机关就两处取得的工资薪金所得合并，自行纳税申报，并缴纳税款。具体计算如下：
A公司代扣代缴个税：
（5000-3500）×3%-0＝45元
B公司代扣代缴个税：
（3700-3500）×3%-0＝6元
每月7日前到选定的其中一税务机关合并申报个税：
[（5000+3700）-3500]×20%－555－（45+6）＝434元
该员工合并申报个税，尚需补交个税：434元。