公司注册资金未缴清的情况下，也可以正常办理公司注销，只需将印花税补交完成即可。但需分清两种情况：
公司无债务问题，可正常办理公司注销； 如：企业注册资金为500万，后期因某种原因不在继续经营，需要办理注销，注册资金未缴清。而企业无债务问题，那么只需补交注册资金的万分之二点五的印花税，即1250元后可办理公司注销。
公司存在债务问题，需先缴清债务才能办理公司注销。 如：企业注册资金为500万，后期因某种原因不在继续经营，需要办理注销，注册资金未缴清，并且企业存在债务问题。那么企业就必须先处理债务问题，处理完成后再补交印花税就可进行公司注销。