经营部查账征收是指税务机关对纳税人的经营情况进行核查，发现未申报或少申报税款的情况，要求纳税人补缴税款的一种征收方式。纳税人应按照以下步骤进行申报：
接到税务机关的通知后，纳税人应尽快组织会计人员对涉及的税款进行核对，确认是否存在未申报或少申报的情况。
如确实存在未申报或少申报的情况，纳税人应在规定的期限内向税务机关申报并缴纳相应的税款。
在申报时，纳税人应填写《税务机关查账征收通知书》并提交相关证明材料，如纳税申报表、发票等。
纳税人应认真履行补缴义务，如有疑问可以向税务机关咨询或申请复议。
需要注意的是，纳税人应严格遵守税法规定，如实申报纳税，避免出现未申报或少申报的情况，以免给企业带来不必要的经济损失。