稽查工作分选案、检查、审理、执行四个环节进行。
选案，国税机关根据公民举报，情报交换或通过微机网络分析筛选有嫌疑的，征管分局移交的嫌疑对象进行计算机或人工排列后列出稽查重点户；
检查，税务稽查的检查工作，是根据选案所确定的稽查对象，组织稽查人员寮施检查，采取必要的方法、措施和手段，收集案件的证人、证言，原始书证材料，整理制作《税务稽查报告》直接将案件移送审理的活动过程；
审理，税务稽查审理，是税务稽查机构立案查处的各类税务违法案件在检查完毕基础上，由专门核准事实、审查鉴别证据、分析认定案件性质，制作《审理报告》和《税务处理决定》或《税务稽查结论》的活动过程；
执行，执行人员将《税务处理决定书》送达被查对象，监督其执行。被查对像拒不履行纳税义务的，执行人员可填制《税收保全措施审批表》，报经县以上局长批准后，依法对被查对象采取税收强制措施，必要时移送公安机关处理。
税务稽查办案流程选案。
对企业信息分析后选出案源,加上上级下达、外部门协查、举报、以及注销税务登记等各类案件下达给检查部门检查。
检查。
检查不一定是要调账检查,还可以选择实地检查,以实际情况为准。
检查部门检查完毕后,将证据以及各项资料形成案卷提交给审理部门。
审理。
审理部门根据案卷提供的信息对案卷进行审理,看证据取得是否合法规范、各种程序是否合法规范、是否同意检查人员的拟处理意见,最终形成结论性文书,并提交至案件执行部门。
执。
执行部门根据结论性文书同企业联系,进行补缴税款罚款滞纳金等事宜,执行完毕后形成执行报告,并将缴款凭证复印件等资料交给案卷管理人员,案卷管理人员将整理稽查案卷并将案卷入库保管。
税务稽查局的工作流程正面回答稽查工作分选案、检查、审理、执行四个环节进行:1、选案；国税机关根据公民举报，部门转办，互有交办，情报交换或通过微机网络分析筛选有嫌疑的；2、检查；税务稽杏的检杏工作，是根据选案所确定的稽杏对象；3、审理；内容包括:事实、证据是否清楚、确凿；适用法律是否正确;程序是否合法:被查人意见：处理意见是否得当；4、执行；税务所将税务处理决定书送达纳税人、扣缴义务人，开具税收缴款书。
分析详细检查前的事项税务稽查人员在实施稽查之前，除下列三种情况之外，应当提前以书面形式向被查对象下达税务稽查通知书，并要求收件人填写税务文书送达回证取回存档。
公民举报有税收违法行为的;稽查机关有根据认为纳税人有税收违法行为的:预先通知有事碍稽查的。
税务稽查局回避制度回避制度稽查人员与被查对象有下列关系之一的，应当回避，被查对象也有权要求他们回避。
稽查人员与被查当事人有近亲属关系的；2、稽查人员与被查对象有利害关系的；3、稽查人员与被查对象有其他关系可能影响公正执法的。