三证合一以后，营业执照变更了新法人，但税务方面还没变更，会有的影响有以下：
公司会无法开发票，因为需要重新领购时税务局会要求更换税字号，需要重新刻制发票专用章，换领新发票；
公司本身正常在报税，已经有报税的数字证书，有可能会因为这个三证合一的事情导致密码无法登陆，需要到前台重置。
变更税务登记是指纳税人办理设立税务登记后，因税务登记内容发生变化，向税务机关申请将税务登记内容重新调整为与实际情况一致的一种税务登记管理制度。
扣缴义务人发生所规定的税务登记内容变化之一者，均应自工商行政管理机关办理变更登记或自政府有关部门批准或实际变更之日起30日内，持有关证件，向原税务登记主管机关申请办理变更税务登记。