法律主观：在实践中，公司或者一些用人单位，开具出来的发票一般一方面用来作为纳税凭证，另一方面是用来证明是否发生了该项实质业务，而增值税专用发票除了具备上述功能外，还要用来抵扣进项税。增值税专用发票抵扣联丢失处理：1、扣税凭证丢失时由直接保管人承担相应责任。2、丢失已开具专用发票的发票联和抵扣联，且丢失前已认证相符的，由专业部门经办人负责协调与销售方联系，取得相应专用发票记账联复印件(加盖发票专用章)及销售方主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》或《丢失货物运输业增值税专用发票已报税证明单》(以下统称《证明单》)，并及时传递给发票管理人员，作为增值税进项税额的抵扣凭证。专用发票记账联复印件和《证明单》留存备查，按照扣税凭证归档要求进行管理。丢失已开具专用发票的发票联和抵扣联，如果丢失前未认证的，由专业部门经办人负责协调与销售方联系，取得相应专用发票记账联复印件(加盖发票专用章)及销售方所在地主管税务机关出具的《证明单》，并及时传递给发票管理人员，发票管理人员凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件进行认证，认证相符的，可凭专用发票记账联复印件及销售方主管税务机关出具的《证明单》，作为增值税进项税额的抵扣凭证。3、公司丢失已开具专用发票的抵扣联，如果丢失前已认证相符的，可使用专用发票的发票联复印件留存备查;如果丢失前未认证的，可使用专用发票的发票联认证，专用发票的发票联复印件留存备查。4、公司丢失已开具专用发票的发票联，可将专用发票抵扣联作为记账凭证，专用发票抵扣联复印件留存备查。综合上述，我们了解到增值税专用发票在丢失抵扣联或发票联其中一联的，处理起来就比较简单，但如果抵扣联和发票联同时丢失的，处理起来相对就复杂很多。
法律客观：《中华人民共和国发票管理办法实施细则》第二条 在全国范围内统一式样的发票，由国家税务总局确定。 在省、自治区、直辖市范围内统一式样的发票，由省、自治区、直辖市税务局（以下简称省税务局）确定。 《中华人民共和国发票管理办法实施细则》第三十一条 使用发票的单位和个人应当妥善保管发票。发生发票丢失情形时，应当于发现丢失当日书面报告税务机关。 《中华人民共和国发票管理办法实施细则》第二十七条 开具发票后，如发生销货退回需开红字发票的，必须收回原发票并注明“作废”字样或取得对方有效证明。 开具发票后，如发生销售折让的，必须在收回原发票并注明“作废”字样后重新开具销售发票或取得对方有效证明后开具红字发票。
增值税抵扣联怎么做账？丢失了还能抵扣吗？增值税专用发票第二联为抵扣联，属于购买方扣税凭证，如果增值税抵扣联丢了该怎么做账?丢失了该如何认证抵扣?增值税抵扣联如何做账?取得增值税专用发票，抵扣后，做以下分录处理：借：管理费用/原材料等贷：应交税费-应交增值税-进项税(发票认证后确认进项税可抵扣)银行存款/现金增值税专用发票抵扣联丢失还能抵扣吗?增值税专用发票第二联为抵扣联，是购买方扣税凭证，一般纳税人丢失已开具专用发票的抵扣联，在丢失前已经认证相符的前提下，可以使用专用发票发票联复印件留存备查;在丢失前未认证的情况下，可以使用专用发票发票联认证，专用发票发票联复印件留存备查。
所以增值税专用发票抵扣联丢失了也是能抵扣认证的。
增值税专用发票开具要求1、填写项目应齐全，全部联次一次填开，注意上下联内容和金额要一致；2、字迹清楚，不得涂改，如果填写增值税专用发票有误，则应另行开具，且在相应发票上注明“误填作废”；3、发票联和抵扣联都应加盖单位发票专用章；4、纳税人开具专用发票应先加盖专用发票销货单位栏戳记。
增值税怎么进行抵扣？增值税是什么?1、增值税是指商品在流转过程中产生的增值额作为计税依据而征收的一种流转税。
其纳税人分为一般纳税人和小规模纳税人。
增值税的征收范围包括销售货物、提供应税劳务、进口货物。
增值税专用发票抵扣联丢失如何处理？增值税专用发票和每个纳税人息息相关，但有些时候难免出现丢失部分联次的情况，丢失增值税专用发票抵扣联时，该怎么处理？增值税专用发票抵扣联丢失的处理办法纳税人丢失已开具增值税专用发票或机动车销售统一发票的抵扣联，可凭相应发票的发票联复印件，作为增值税进项税额的抵扣凭证或退税凭证。
如果纳税人丢失已开具增值税专用发票或机动车销售统一发票的发票联，可凭相应发票的抵扣联复印件，作为记账凭证。
如果纳税人同时丢失已开具增值税专用发票或机动车销售统一发票的发票联和抵扣联，可凭加盖销售方发票专用章的相应发票记账联复印件，作为增值税进项税额的抵扣凭证、退税凭证或记账凭证，而不再需要办理《丢失增值税专用发票已报税证明单》。
什么是增值税？增值税是一种流转税，以商品（含应税劳务）在流转过程中产生的增值额作为计税依据。
增值税对商品生产、流通、劳务服务中多个环节的新增价值或商品的附加值征收，并且增值税实行价外税，有增值才征税，没增值不征税，由消费者承担。
增值税的收入占中国全部税收的60％以上，是我国最主要的税种之一。
增值税的税率分别为13％、9％、6％和零税率。
增值税专用发票有什么用途？增值税专用发票仅限于增值税一般纳税人领购使用，由国家税务总局监制设计印制。
它和每个纳税人息息相关，因为其既作为纳税人反映经济活动中的重要会计凭证，又是销货方纳税义务和购货方进项税额的合法证明。