灵活就业人员首次参保可选择通过当地相关部门所属的人事档案托管机构代办，也可自行到居住地或户籍地县级医保经办机构以个人身份办理（首次参保需携带身份证原件，非本地户籍的还需携带本地居住证）。
灵活就业人员由在职转为退休的，需持退休审批表，到参保地医保经办机构办理医保在职转退休手续，核算职工医保缴费年限，年限不够补足后转为退休身份，身份变更次月起，不再缴纳基本医疗保险费，只缴纳大病互助基金。
市医保经办中心负责市级三家人事档案托管机构（市人才交流中心、市档案托管中心、市劳务派遣中心）管理的灵活就业人员的参保事宜。
档案托管机构统一为其办理医保参保登记手续。