在工程分包的情况下，总承包方应按合同总金额减去支付给分包方的价款后的余额计算并缴纳营业税，分包方应对分包方完成的分包金额承担相应的纳税义务。
分包与总包有直接的合同约束，具有相应的责任连带关系，一般由总包或者业主负责，总包负责一般分包，业主负责指定分包。
根据《国家税务总局关于印发的通知》： 一、从事建筑安装业的工程承包人、个体户及其他个人为个人所得税的纳税义务人。
其从事建筑安装业取得的所得，应依法缴纳个人所得税。
关于具体征收方式，对未设立会计账簿，或者不能准确、完整地进行会计核算的单位和个人，主管税务机关可根据其工程规模、 工程承包合同 （协议）价款和工程完工进度等情况，核定其应纳税所得额或应纳税额，据以征税。
而具体核定办法由县以上（含）县级税务机关制定。
民法典 》第八条 民事主体从事民事活动，不得违反法律，不得违背公序良俗。
工程总包和分包分别如何缴税法律主观：根据税 法规 定：分包先交税先开，一般总包方是可以抵扣分包金额已缴的营业税的，即总包方按分包后的合同余额缴纳营业税。 根据《中华人民共和国营业税暂行条例》纳税人将建筑工程分包给其他单位的，以其取得的全部价款和价外费用扣除其支付给其他单位的分包款后的余额为营业额;根据《国家税务总局关于劳务承包行为征收营业税问题的批复》国税函〔2006〕493号规定建筑安装企业将其承包的某一工程项目的纯劳务部分分包给若干个施工企业，按照现行营业税的有关规定，施工企业提供的施工劳务属于提供建筑业应税劳务，因此，对其取得的收入应按照“建筑业”税目征收营业税。
法律客观：根据《营业税暂行条例》的规定，建筑业的总承包人将工程分包或者转包给他人，以工程的全部承包额减去付给分包人或者转包人的价款后的余额为营业额。也就是说，存在工程分包的情况下，总承包单位应以全部承包额减去付给分包方价款后的余额计算缴纳营业税，分包人应该就其完成的分包额承担相应的纳税义务。同时，按照规定，总承包人属于法定的代扣代缴纳税义务人，在与分包方办理已完工程价款结算时，还应以与分包方结算的工程价款为依据计算并代扣代缴其营业税。总承包人代扣代缴分包人营业税后，应按规定对分包人开具《中华人民共和国代扣代收税款凭证》，分包人以此作为其完税凭证。大型工程项目施工往往涉及多个行政区域，而营业税属于地方税，由于地方利益竞争，在纳税实践中分包工程的纳税地点有时也成为焦点问题。按照《营业税暂行条例》的规定，建筑安装业务实行分包或转包的，总承包人应该按照建筑业营业税纳税地点的规定，扣缴分包或转包人应缴的营业税，即建筑业营业税的纳税地点在什么地方就在什么地方代扣代缴，具体来说就是：①非跨省工程的分包或转包，由扣缴人在工程所在地代扣代缴。②跨省工程的分包或转包，由扣缴人在扣缴人的机构所在地代扣代缴;如果分包或转包人将工程再一次分包或转包出去，有一段工程仍是跨省工程，该段跨省工程的营业税亦由总承包人在其机构所在地代扣代缴。如中铁公司(驻北京)承包郑州至武汉的某高速公路工程，把其中两部分分包给甲、乙两施工企业，分段分包或转包后，如果没有跨省，则这两个施工企业应缴纳的营业税由中铁公司代扣后，在工程所在地缴纳;如果工程跨省，则跨省工程的营业税，由中铁公司代扣后在北京缴纳;如果甲企业将所分包的跨省工程的一部分再次分包给丙、丁两企业，若丙企业所分包的工程未跨省，其应缴营业税由中铁公司代扣后，在工程所在地缴纳，若丙企业所分包的工程跨省，其应缴营业税仍由中铁公司代扣后在北京缴纳。另外，建筑安装工程的总承包人为境外机构，且其在中国境内没有经营机构或代理者的，不管此工程是否实行分包或转包，全部工程应纳的建筑业营业税税款均由建设单位扣缴。在会计核算时，分包工程的营业税等流转税由承包方代扣代缴，并由承包方从每期的分包进度款中扣回，这部分流转税形成分包方企业的营业税金及附加;与承包方自行完成部分的营业额相关的流转税形成承包方企业的营业税金及附加。
分包工程税务怎么处理分包工程税务怎么处理1、分包工程税务的处理方法是：（1）一般纳税人提供建筑服务适用的税率为11%；（2）一般纳税人提供建筑服务适用简易计税方法的，征收率为3%；（3）小规模纳税人提供建筑服务，征收率为3%。
法律依据：《中华人民共和国税收征收管理法》第一条为了加强税收征收管理，规范税收征收和缴纳行为，保障国家税收收入，保护纳税人的合法权益，促进经济和社会发展，制定本法。
第二条凡依法由税务机关征收的各种税收的征收管理，均适用本法。
第三条税收的开征、停征以及减税、免税、退税、补税，依照法律的规定执行；法律授权国务院规定的，依照国务院制定的行政法规的规定执。
单位和个人不得违反法律、行政法规的规定，擅自作出税收开征、停征以及减税、免税、退税、补税和其他同税收法律、行政法规相抵触的决定。
第四条法律、行政法规规定负有纳税义务的单位和个人为纳税人。
行政法规规定负有代扣代缴、代收代缴税款义务的单位和个人为扣缴义务人。
扣缴义务人必须依照法律、行政法规的规定缴纳税款、代扣代缴、代收代缴税款。
工程公司把工程分包合法吗工程公司把工程分包合不合法是根据具体情况而定。
当承包工程中的部分工程发包给具有相应资质条件的分包单位而且是经建设单位认可，建筑工程主体结构的施工仍然是由总承包单位自行完成的，那么分包是合法的。
建筑工程总承包单位可以将承包工程中的部分工程发包给具有相应资质条件的分包单位；除总承包合同中约定的分包外，必须经建设单位认可。