第一步 登录“自然人税收管理系统扣缴客户端”。
第二步 进入“人员信息采集”模块。
第三步 点“添加”进行具体人员信息采集。
第四步 完成“人员信息采集”后，点“综合所得申报”按钮进入收入填写界面。
第五步 当系统弹出“确认信息”提示框时点确定。
第六步 上月有数据时点复制上月数据，电脑上下载有标准模板并且完成模板数据填写时点标准模板导入，第一次操作系统时点点“生成工资记录，用户手工修改”。
第七步 输入本月工人工资收入数据。
第八步 点计算“税款计算”系统自动计算税款。
第九步 系统完成税款计算后转入下一步“申报表”报送。
第十步 当点“申报表报送”且“综合所得预扣预缴表”所在行末端是否可以进行申报体现 为“是”时点申报表报送。
第十一步 点“获取反馈”查看是否申报成功。
第十二步 当获取的反馈信息为“申报成功”时完成所有操作，当申报不成功时点“获取反馈”后系统会提示"申报不成功"并指出问题出现在哪些，按系统提示完善相关操作即可申报成功。