在大众创新，万众创业的时代，设立公司还是很容易的。但是，不是所有的公司都可以获得成功。创业公司倒闭的概率还是很大的。
公司在运行的时候，如果存在一些不合规的问题，公司在注销的时候，也会遇到困难。
企业注销需要注意哪些税务问题?
存货问题
企业在注销时，如果账上还是货，也是需要缴纳增值税的。另外，即使账上没有货了，但是实际存在库存的，也需要视同销售缴纳增值税、企业所得税。
印花税
印花税的金额虽然不大，但是企业忽略的情况比较普遍。企业在注销以前，一定要自查一下，印花税相关事项。
有的企业可能在营业期间，一直都没有缴纳过印花税。企业的这些“病”，都会在注销的时候显现出来!
个人所得税
在个税方面，要看一下企业是不是存在股东借款不还的情况。如果存在股东借款不还的情况，需要按照分红处理。同时需要为股东，代扣代缴个人所得税。
企业注销时，如果处理账上的实际存货?
企业在注销的时候，还有货存在，肯定是大概率事件。这个时候，企业肯定需要把这些货分给股东。
但是，企业不是直接给股东就可以了。《增值税暂行条例实施细则》里面明确规定，企业在把商品分给股东的情况，属于视同销售的情况。意思就是说，这个货虽然分给股东，也需要按照市场价格计算增值税。
账面大于库存怎么处理?
如果金额小还好说，如果金额大了，企业需要补交的税款也是一笔不小的费用。
之所以出现这样的情况，是因为企业存在一些未开票收入。所以这部分存货，不仅需要视同销售缴纳增值税，同样也需要缴纳企业所得税。如果情况严重，企业还需要缴纳罚款和滞纳金。
所以，企业在平时的时候，就需要按时核对一下相关账目。发现账实不符的时候，一定要及时处理，而不要把这些问题累积起来，到注销的时候，才去处理。
货物因自然灾害损坏了，怎么处理?
在大自然面，我们也是很无能为力。企业的货物如果是被自然灾害损坏的，是可以按照意外损失处理的。
如果企业当时未处理，现在就需要提供相关资料了。如果企业没有证据可以证明，那么企业就需要把进项税额进行转出处理了。
公司注销后有税务问题如何处理法律主观：公司经营就离不来经济往来相关活动，因此免不了就会涉及到一些税务上问题。但一般收税纳税都是公司发展中一笔不小的经济压力，但不可避免就算是公司要注销，也是需要办理好税务上的问题。一、公司注销要处理那些税务问题1、印花税在企业注销的时候，却显得非常重要，该补的要赶紧补齐。因为有关企业的重大合同，均会进行印花税审核。实收资本、资本公积、营业账簿、租赁、购销合同都要检查。2、账面存货要交税账面存货一般会出现在商贸批发行业中的企业。比如说，某商贸批发企业，不想继续经营了，准备进行注销，账面上还有存货，则会分配给股东或者投资者，作为出资的收回或者利润的分配。3、账面库存大于实物库存往往注销企业出现账面库存大于实物库存的原因，是因为商品销售后漏报了收入而导致的。可能出现在公司注销时，账面上有库存，但实际上仓库里面什么都没有了的情况。而出现这种状况，税务实地核查后，轻则按视同销售来处理，重则需要补交滞纳金。4、库存坏了针对食品销售公司，在注销时，例如，仓库中有150万元（含税）的食品因管理不善而导致过期，发票已经认证抵扣了。虽然账面上这150万元确实不值钱，但是根据增值税管理办法，因管理不善造成的损失，之前做了进项抵扣的必须进项转出。二、公司注销税务处理方式1、公司注销如果是地税共管户，那么一般纳税人首先就应该办理国税注销登记，注销登记办理好了之后自取处理地税注销登记。2、登记地税和国税纳税人还需要填写《注销税务登记申请表》，并到主管区局申请清缴发票和清缴税款。3、纳税人办理清缴发票和清缴税款之后，持《注销税务登记表》前往主管区局或者是主管税务办事处的综合服务窗口办理注销。4、税务人员录入注销税务登记受理信息，并向纳税人发放受理回执。同时主管税务机关需要对纳税人实施注销税务稽查(核准)。5、纳税人凭主管税务机关实施注销税务稽查(核准)后加盖同意注销意见的《注销税务登记申请表》、原注销受理回执及税务登记证到主管区局或主管税务所的综合服务窗口办理注销核准手续。6、税务人员的受理纳税人的注销核准申请后，收回纳税人的税务登记证件正、副本并为纳税人开具《注销税务登记通知书》。三、注销税务登记的期限1、纳税人发生解散、破产、撤销以及其他情形，依法终止纳税义务的，应当在向工商行政管理机关或者其他机关办理注销登记前，持有关证件向原税务登记机关申报办理注销税务登记；按照规定不需要在工商行政管理机关或者其他机关办理注册登记的，应当自有关机关批准或者宣告终止之日起15日内，持有关证件向原税务登记机关申报办理注销税务登记。2、纳税人因住所、经营地点变动而涉及改变税务登记机关的，应当在向工商行政管理机关或者其他机关申请办理变更或注销登记前或者住所、经营地点变动前，向原税务登记机关申报办理注销税务登记，并在30日内向迁达地税务机关申报办理税务登记。3、纳税人被工商行政管理机关吊销营业执照或者被其他机关予以撤销登记的，应当自营业执照被吊销或者被撤销登记之日起15日内，向原税务登记机关申报办理注销税务登记。
法律客观：《中华人民共和国市场主体登记管理条例实施细则》第四十六条申请办理注销登记，应当提交下列材料：（一）申请书；（二）依法作出解散、注销的决议或者决定，或者被行政机关吊销营业执照、责令关闭、撤销的文件；（三）清算报告、负责清理债权债务的文件或者清理债务完结的证明；（四）税务部门出具的清税证明。除前款规定外，人民法院指定清算人、破产管理人进行清算的，应当提交人民法院指定证明；合伙企业分支机构申请注销登记，还应当提交全体合伙人签署的注销分支机构决定书。个体工商户申请注销登记的，无需提交第二项、第三项材料；因合并、分立而申请市场主体注销登记的，无需提交第三项材料。
公司注销5大税务问题,一定要解决好!当前，很多公司经营不下去会选择进行公司注销。而就公司注销来讲，公司在注销前会经过一系列的审核。这就导致许多老板产生这样一个认识误区：认为公司只要注销了，即便后面被发现税务相关问题也与自己无关了。事实上，这一观点是错误的。
因此，公司要想不被查，先得会自查，在办理公司注销前，这些容易“爆雷”的坑一定要妥善处理。具体包括以下情形：
账面有存货，但无实物
已经销售的货物不做账、不开发票，隐瞒销售收入，同时销售成本不结转，导致账面存货数大于实际库存数。
处理办法：需立即进行自查，并补缴增值税、企业所得税等税款。
存货损毁需查明原因，如果有充分证据证明属于合理损耗，那么增值税无需处理，损失也可以在企业所得税前扣除。
账面有存货，但已过期
该情况有两种处理方式：
作为资产损失处理；
低价销售。
增值税有留抵不能退，开票给关联方了
在此需要提醒注意的是：与关联公司之间的交易必须有合理的商业目的，且价格公允，否则，可能会被认定为虚开发票！
老板从公司借款未归还
企业注销前一定要好好自查一下“其他应收款”等往来科目。
印花税未足额缴纳
印花税的征税范围非常广泛，购销、租赁、注资、营业账簿等都涉及印花税。
而这平时不起眼的小税种在注销的时候通常会被税务局翻个底朝天。
此外，如今随着金税四期到来，预警系统会更为严密，公司正常经营期间一定要：如实申报、四流合一。否则，一旦税务存在问题，即便是公司注销了，也会依法追究公司责任。
公司注销常见税务问题1、非正常户如何注销？
被纳入了非正常户的企业，还需要先补充纳税申报、补缴税款并缴纳相应的滞纳金和罚款，解除非正常状态后，才能按照正常程序提交注销申请。
注销时税务要查三年的账吗？
目前税收法规并没有明确规定公司注销时必须查账，要视企业的具体情况而定。之所以有查三年账的说法，是因为《税收征管法》第五十二条对税款追缴期有规定：“因税务机关的责任，致使纳税人、扣缴义务人未缴或者少缴税款的，税务机关在三年内可以要求纳税人、扣缴义务人补缴税款，但是不得加收滞纳金。”再次提醒大家：不要以为注销完就没事了，如果有偷税漏税等违法行为，税务机关可以无限期追责。
公司注销与吊销有何区别?
该怎么处理非正常注销?
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