三证合一，只是证件合一，是在政府职能部门的备案号合一，与以后记帐报税没有任何关系。
原来怎么记账报税，就还是怎么记账报税。
新公司办理好三证合一的营业执照后，还需要到国税和地税去进行登记。
一般情况下，专管员会主动通知纳税单位。
也可以主动联系专管员。
进行纳税认证。
三证合一后税务怎么办 办理涉税事项有哪些变化所谓“三证合一”，就是将企业依次申请的工商营业执照、组织机构代码证和税务登记证三证合为一证，提高市场准入效率;“一照一码”则是在此基础上更进一步，通过“一口受理、并联审批、信息共享、结果互认”，实现由一个部门核发加载统一社会信用代码的营业执照。
“三证合一”后，纳税人办理涉税事项有哪些新变化 一是不用进行税务登记，不再领取税务登记证。企业办理涉税事宜时，在完成补充信息采集后，凭加载统一代码的营业执照可代替税务登记证使用。
二是对于工商登记已采集信息，税务机关不再重复采集;其他必要涉税基础信息，可在企业办理有关涉税事宜时，及时采集，陆续补齐。发生变化的，由企业直接向税务机关申报变更，税务机关及时更新税务系统中的企业信息。
三是企业办理注销登记，须先向税务主管机关申报清税，填写《清税申报表》(附后)。企业可向国税、地税任何一方税务主管机关提出清税申报，税务机关受理后将企业清税申报信息同时传递给另一方税务机关，国税、地税税务主管机关按照各自职责分别进行清税，限时办理。
清税完毕后一方税务机关及时将本部门的清税结果信息反馈给受理税务机关，由受理税务机关根据国税、地税清税结果向纳税人统一出具《清税证明》，并将信息共享到交换平台。在清税后，经举报等线索发现少报、少缴税款的，税务机关将相关信息传至登记机关，纳入“黑名单”管理。
实行“一照一码”登记模式后，纳税人如何办理纳税申报 纳税人在办理工商登记，领取营业执照时，等同于办理了税务登记证，应在领取营业执照之日起15日内将其财务、会计制度或财务、会计处理办法报送主管税务机关备案，在开立存款账户之日起15日内，向主管税务机关报告全部账号，并按规定进行申报纳税。需要网上申报的，请前往主管税务机关开通“网上(电子)办税服务厅”网报功能。
三证合一后税务登记办理流程法律主观：一、三证合一后新开立企业税务登记流程是怎样的三证合一办理具体流程：1、提供资料：营业执照、代码证、国税地税税务登记证正副本原件、经办人身份证原件、法人身份证原件及复印件、申请表。2、办理流程(1)先去政务大厅办理三证合一(2)去地税办理地税登记，之后去所属分局大厅登记(3)去国税局大厅及所属地税分局大厅登记【注】登记前，如果属于一般纳税人的，应在国税登记前将开回的专用发票及开出的专用发票都进行认证，避免登记后因税号不同造成不能认证的麻烦。(4)重新办理国税、地税三方协议(5)开票系统重新发行(6)重新刻发票专用章二、税务申报的流程是怎样的1、纳税登记：纳税登记通俗来讲，就是纳税人在去税局登记报道。法律规定，企业在领取营业执照后30天之内，带上相关证件和材料去税局办理税务登记，税局收到企业的相关材料后自申报日起30天之内审核并发给单位企业税务登记证。2、税务认定：税务认定就是确认纳税人是一般纳税人还是小规模纳税人：确认企业征收税款的方式是什么，是查账征收、核定征收还是代扣代缴等，这些都是单位和税局共同决定的。3、发票和税盘：根据相关法律规定，已经核税的企业可以向税务机关购买税控盘零购发票，依据公司业务开具发票了。4、报税：报税的方式一般分两种：上门申报和网上申报；5、完税证明：在企业成功纳税以后，在税务大厅可以收到完税凭证，如果您是网上报税可以去税务机关要求提取完税证明。
法律客观：《个体工商户条例》第十六条 登记机关和有关行政机关应当在其政府网站和办公场所，以便于公众知晓的方式公布个体工商户申请登记和行政许可的条件、程序、期限、需要提交的全部材料目录和收费标准等事项。 《个体工商户条例》第十七条 个体工商户在领取营业执照后，应当依法办理税务登记。 个体工商户税务登记内容发生变化的，应当依法办理变更或者注销税务登记。