我也遇到了同样的事，是不是升级了深圳国税网上申报系统才这样的？？ 弄了几天，打电话给国税局和税友，打了很多电话排了大半小时好不容易才接通，工作人员提出了很多个可能性，总的来说就是：
这种情况有可能是因为你采集的发票不正确，数字错了；
可能是采集发票的位置错了…… 给出的解决方法就是：重新导入发票或者手工输入数据。
不过我最后的解决方法是：在 www.82980755.com网上下载了“深圳国税网上申报系统手工升级包V7.1.004-V7.1.008”，2015年2月5日更新的，安装后就解决了这个问题。希望对你有用！