主要分几步：
第一步:申领合作社法人营业执照
办理部门:工商行政管理局
依据:《合作社登记管理条例》
提交材料:
设立登记申请书；
全体设立人签名(盖章)的设立大会纪要；
全体设立人签名、盖章的章程；4、法定代表人、理事的任职文件和身份证明；
全体出资成员签名、盖章予以确认的出资清单；
法定代表人签署的成员名册和成员身份证明复印件；7、住所使用证明；8、指定代表或者委托代理人的证明；9、合作社名称预先核准申请书；
业务范围涉及前置许可的文件。注册工商局收费内容:不收任何费用。注意事项:农民专业合作社法人营业执照不需要年检。
第二步:办理合作社公章办理部门:公安局依据:《公安部印章管理办法》提交材料:合作社法人营业执照复印件、法人代表身份证复印件、
经办人身份证复印件。收费内容:刻章费,根据材料不同(收费)。
注意事项:目前专业合作社需要的公章有行政章、
财务专用章、法人代表章共三枚。
第三步:农经办办理登记(农业局下属农经办)提交材料:需拿工商注册执照
合作社简介(简介注明:理事长名字,电话,合作社办公地址,邮箱)
第四步:申领组织机构统一代码证
办理部门:质量技术监督局
依据:组织机构代码管理办法
提交材料:
合作社法人营业执照副本原件及复印件一份(正面盖合作社公章)；
合作社法人代表及经办人身份证原件及复印件一份；
如受他人委托代办的,须持有委托单位出具的代办委托书面证明。
收费内容:根据当地政策。
注意事项:
合作社自工商局批准成立或核准登记成立之日起30日内办理组织代码证。
代码证有效期限为四年,到期须要换证；代码证实行年检制度；需年审费(根据当地政策)。
第五步:申领税务登记证
办理部门:国家、地方税务局
依据:《税务登记管理办法》
提交材料:1、法人营业执照副本及复印件；
组织机构统一代码证书副本及复印件；
法定代表人(负责人)居民身份证或者其他证明身份的合法证件复印件；
经营场所房屋产权证书复印件；
成立章程或协议书复印件；
收费内容:
2009年中央一号文件明确,将合作社纳入税务登记系统
免收税务登记工本费。
注意事项:
合作社应当自领取工商营业执照之日起30日内申报办理税务登记
未按照规定期限申报办理者,可处2000元以下的罚款。
税务登记证定期验证、换证和年检,一年验证一次,三年更换一次。
第六步:办理银行开户和账号
办理部门:农业银行、(农村信用社)
依据:《银行账户管理办法》
提交材料:
法人营业执照正、副本及其复印件；
组织机构代码证书正、副本及其复印件；