从一般纳税人购进农产品，按照取得的增值税专用发票上注明的增值税额，从销项税额中抵扣; 2、进口农产品，按照取得的海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额，从销项税额中抵扣; 3、从按照简易计税方法依照3%征收率计算缴纳增值税的小规模纳税人取得增值税专用发票的，以增值税专用发票上注明的金额和9%的扣除率计算进项税额; 4、取得农产品销售发票的，以农产品销售发票上注明的农产品买价和9%的扣除率计算进项税额; 5、开具农产品收购发票的，以农产品收购发票上注明的农产品买价和9%的扣除率计算进项税额; 6、农产品进项税额核定扣除，按照《农产品增值税进项税额核定扣除试点实施办法》(财税〔2012〕38号)等文件规定，纳税人购进农产品，不再凭扣税凭证直接抵扣增值税进项税额，而是根据购进农产品所生产的商品或服务的销售情况，按照一定扣除标准，核定出当期农产品可抵扣的进项税额; 7、加计扣除。
营业税改征增值税试点期间，纳税人购进用于生产销售或委托受托加工9%税率货物的农产品维持原扣除力度不变。
农产品如何抵扣进项税农产品如何抵扣进项税?
购进农产品，除取得增值税专用发票或者海关进口增值税专用缴款书外，按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和13%的扣除率计算的进项税额。计算公式为:进项税额=买价×扣除率买价，是指纳税人购进农产品在农产品收购发票或者销售发票上注明的价款和按照规定缴纳的烟叶税。 购进农产品，按照《农产品增值税进项税额核定扣除试点实施办法》抵扣进项税额的除外。 一般纳税人购进农产品抵扣进项税额存在如下5种情况: 1、从一般纳税人购进农产品，按照取得的增值税专用发票上注明的增值税额，从销项税额中抵扣。 2、进口农产品，按照取得的海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额，从销项税额中抵扣。 3、购进农产品，按照取得的农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和13%的扣除率计算的进项税额，从销项税额中抵扣。 4、从农户收购农产品，按照收购单位自行开具农产品收购发票上注明的农产品买价和13%的扣除率计算的进项税额，从销项税额中抵扣。 5、按照《财政部国家税务总局关于在部分行业试行农产品增值税进项税额核定扣除办法的通知》(财税〔2012〕38号)规定，生产销售液体乳及乳制品、酒及酒精、植物油实行核定扣除。《国家税务总局关于在部分行业试行农产品增值税进项税额核定扣除办法有关问题的公告》(国家税务总局公告2012年第35号)明确了具体核定方法。 后续《财政部国家税务总局关于扩大农产品增值税进项税额核定扣除试点行业范围的通知》(财税〔2013〕57号)规定，各地可根据实际情况自行扩大核定扣除范围。
购买农产品的增值税怎么抵扣购买农产品的增值税抵扣方式如下：1、计算抵扣，凭农产品收购发票、销售发票、国税通用机打发票上注明的价款按13%扣除率计算抵扣；2、凭票抵扣，凭增值税专用发票上的税额抵扣进项。
增值税是对销售货物或者提供加工、修理修配劳务以及进口货物的单位和个人就其实现的增值额征收的一个税种。
增值税抵扣，应交的税费=销项税减进项税。
下列项目免征增值税：1、农业生产者销售的自产农产品；2、避孕药品和用具；3、古旧图书；4、直接用于科学研究、科学试验和教学的进口仪器、设备；5、外国政府、国际组织无偿援助的进口物资和设备；6、由残疾人的组织直接进口供残疾人专用的物品；7、销售的自己使用过的物品。
《中华人民共和国增值税暂行条例》第八条 纳税人购进货物、劳务、服务、无形资产、不动产支付或者负担的增值税额，为进项税额。
下列进项税额准予从销项税额中抵扣：（一）从销售方取得的增值税专用发票上注明的增值税额。
（二）从海关取得的海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额。
（三）购进农产品，除取得增值税专用发票或者海关进口增值税专用缴款书外，按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和11%的扣除率计算的进项税额，国务院另有规定的除外。
进项税额计算公式：进项税额=买价乘扣除率（四）自境外单位或者个人购进劳务、服务、无形资产或者境内的不动产，从税务机关或者扣缴义务人取得的代扣代缴税款的完税凭证上注明的增值税额。
准予抵扣的项目和扣除率的调整，由国务院决定。
下列项目的进项税额不得从销项税额中抵扣：（一）用于简易计税方法计税项目、免征增值税项目、集体福利或者个人消费的购进货物、劳务、服务、无形资产和不动产；（二）非正常损失的购进货物，以及相关的劳务和交通运输服务；（三）非正常损失的在产品、产成品所耗用的购进货物（不包括固定资产）、劳务和交通运输服务；（四）国务院规定的其他项目。