办理清税证明前，先打开电子税务局，把当期的增值税、附加税、个税、以及各类年报，统统都申报完毕。
如果注销前手里还有未开完的发票，填写发票缴销表，把所有的空白发票全部缴销。
购买了税控机开具发票的企业，填写发票税控机缴销表，把开票系统缴销。
企业有进出口权的，填写出口退（免）税备案撤回申报表，填好后，还需要拷备电子数据，然后前往税局撤回出口退免税备案。
企业注销前，都需要清算企业的资产，同时办理清税证明，税局也会核查企业的清算情况，所以，还需要制作一份清算报告书，列明企业的资产清算情况。
以上5步都办理完结后，填写注销税务登记申请审批表，主要填写公司的基本信息、注销原因、附送的资料，然后盖上公司的公章。
税局收到申报表后，会核查公司1-5步的内容是否办理完结，同时会核查公司是否清缴了税款，如果有必要还会核查公司的账本，核查没有问题后，就会出具一份盖有税局印章的《清税证明》给申请的公司了。