自然人股权转让的收入计算方法复杂，需要考虑多个因素，一般来说并不容易简单计算。
自然人股权转让的收入一般是由其所持股权的转让价款减去成本后，再按照一定比例计算缴纳个人所得税。
计算股权转让的成本是需要考虑多种因素的，如购买该股权所花费的费用、股权转让合同中设定的交易费用和税费等等。
同时，也需要考虑到股权转让所得以及税费缴纳情况与法律法规、税收政策等相关规定的关系，以避免违法行为并确保自己的权益。
综上所述，自然人股权转让的收入计算较为复杂，需要综合考虑多种因素，建议在进行股权转让前，仔细研究和了解相关的法规政策，并咨询相关专业人士的意见和建议。