三证合一公司注销的程序是：
成立清算组，清算组应当自成立之日起十日内通知债权人，并于六十日内在报纸上公告;
公司清算结束后，清算组应当制作清算报告;
公司申请注销登记，登报公告;
经公司登记机关注销登记公告后，公告公司终止。
【法律依据】
根据《公司法》第一百八十八条，公司清算结束后，清算组应当制作清算报告，报股东会、股东大会或者人民法院确认，并报送公司登记机关，申请注销公司登记，公告公司终止。
三证合一后怎么办理企业注销？三证合一改革后，纳税人办理注销税务登记需提供的资料和流程和之前一样，并没有太大的改动
企业注销流程
登报
在公司清算期间即可登报公示，需要在当地工商局认可的报纸进行登报，内资企业只需登报一次，外资企业需要登报3次。最好选择日报进行公示，注销公告至少需要公示45天
注销社保
社保局会核查公司是否存在欠缴情况。通过后领取《社保注销通知单》
注销国、地税
自公司宣告终止之日起15日内，公司需向原税务登记机关申请办理税务注销
到工商局办理公司注销备案
登报公示45天后，可以去公司登记的工商局办理公司注销备案，注销公司营业执照
注销银行账户
前往公司开户行注销公司的开户许可证和银行基本户等其他账户
注销印章
前往公司印章登记的公安机关注销掉公司印章的法律效应
注：非公司制企业比如合伙企业，办理营业执照注销时需要同时将印章交予工商部门，而公司制企业注销印章是销掉公司印章的法律效应，印章可以自己保留或自行销毁
扩展资料：
申办注销公司材料
公司清算组负责人签署的《公司注销登记申请书》
公司签署的《指定代表或者共同委托代理人的证明》及指定代表或委托代理人的身份证复印件;应标明具体委托事项、被委托人的权限、委托期限
清算组成员《备案确认通知书》
依照《公司法》作出的决议或者决定;法院的裁定解散、破产的，行政机关责令关闭的，应当分别提交法院的裁定文件或行政机关责令关闭的决定。因违反《公司登记管理条例》有关规定被公司登记机关依法撤销公司设立登记的，提交公司登记机关撤销公司设立登记的决定
经确认的清算报告
刊登注销公告的报纸报样
行政法规规定应当提交的其他文件;有分公司的公司申请注销登记，还应当提交分公司的注销登记证明
公司的《企业法人营业执照》正、副本
参考资料来源：百度百科—公司注销
参考资料来源：百度百科—公司注销程序
三证合一公司如何注销法律主观：三证合一公司注销的流程是作出解散决议；成立清算组；通知或公告债权人；注销登记；公告公司终止。公司注销后，法人资格消灭，不再享有民事权利能力和民事行为能力。
法律客观：《中华人民共和国民法典》第六十八条 有下列原因之一并依法完成清算、注销登记的，法人终止： （一）法人解散； （二）法人被宣告破产； （三）法律规定的其他原因。 法人终止，法律、行政法规规定须经有关机关批准的，依照其规定。