残疾人保证金的计算方式：应缴纳的保证金=（上年用人单位在职职工人数X所在地省、自治区、直辖市人民政府规定的安排残疾人就业比例 - 上年用人单位时间安排的残疾人及就业人数）X上年用人单位在职职工年平均工资。
残疾人保证金的缴纳流程如下：
残疾人就业情况审核。已安排残疾人就业的用人单位应于8月1日至9月15日，向主管地方税务机关所在地的残疾人就业服务机构申报上年本单位安排的残疾人就业人数，并由该机构进行审核。未在规定时间内申报的，视为未安排残疾人就业。
申报缴纳地点。用人单位应向申报缴纳个人所得税的主管地方税务机关申报缴纳保障金。
申报缴费期限。保障金的申报缴费期限为11月1日至12月15日。