国家级高新技术企业认定申报成功后，可以享受企业所得税减免40%的优惠政策，即根据国家新税法：高新技术企业享受15％的企业所得税（非高新技术企业所得税税率为25％）。如果企业销售额5000万以上，一年省下来的税收都有好几十万。
国家级高新技术企业认定申报成功后，荣誉度比较高，各地政府根据当地实际情况，给予企业一定的资金奖励，促进企业发展。比如合肥市企业新认定为国家级高新技术企业认定后奖励20万元，合肥市高新区的企业另外还有20万的奖金，合肥市经开区、庐阳区、肥西县等另外都有10万的补助。安徽省其它地市如马鞍山、淮北市有30万的奖励。
国家级高新技术企业在购买土地时候，可享受当地政府高新技术企业用地优惠政策（低于同等地价5%-25%的优惠）。
国家级高新技术企业资质也是很多资助类、认定类科技项目的基础，资助类如重大专项、国内国际合作、创新基金等，认定类如研发中心、技术中心，国家技术工程中心等，所以很多科技项目都需要具备国家级高新技术企业资质的基础上申报。
国家级高新技术企业是企业研发实力的象征。高新技术企业不仅申请难度较大，也是对企业技术，研发，社会效益，经济效益等各个方面的全面审查，因此高新技术企业认定证书含金量十分高，对企业扩大市场十分有利。
国家级高新技术企业认定成功后，可以无形中提高企业招投标资质水平，同时高新技术企业认定也是企业上市的加分条件。高新技术企业认定成功后，可以享受的好处主要有以下内容：1、税收减免：经认定的高新技术企业，可执行15%（认定前25%）的优惠税率，税率降低10个点，税额减少40%；2、直接奖励：获得高新技术企业后，可获得地方资金奖励（最多的有百万）；3、融资贷款：更容易获得VC的投资和各大银行的贷款；4、资助基础：是其他申报各类型政府专项资金的首要条件之一；5、品牌提升：科技类企业唯一“国”字招牌企业荣誉，电子商务时代极大利于促进企业异地成交，是企业实力的最佳象征；6、吸引人才：科技创业的核心是优秀人才，这样更能吸引他们；
办公改善：优先获得办公及工业用地，很多地方还可以免费用地；
政府采购：高新技术企业产品优先纳入政府采购体系；
资产折旧：固定资产加速折旧，对财务报表有利；
企业上市：创业板，新三板上市的重要条件之一。