增值税发票风险防控工作规程如下：1、针对虚开发票（包括增值税电子发票）情况风险防控：合作前，全方位了解供应商信息；合作中，密切关注业务执行过程中细节问题；合作后期，及时追要发票，取得发票后及时查验发票真伪、核查商品名称、编码是否与实际业务相符、准确。
针对不合规发票风险防控，在合同上列示发票开具要求。
针对开票方拒绝开具发票风险防范，合同中约定发票开具时间；受票方依据发票请付款等条款。
电子发票风险防控，电子发票重复报销风险、运用微信小程序《电子发票台账》这种电子发票管理平台，可以轻松实现电子发票的查重、防伪、一键生成台账明细管理、使用电子发票扫描枪。
做好企业内控，发票风险防范责任到人。
总局大企业税收服务和管理什么防范税务违法行为依法履行纳税义务《大企业税务风险管理指引（试行）》。
根据查询华律网显示，2009年，国家税务总局印发《大企业税务风险管理指引（试行）》，引导大企业开展税务风险管理，防范税务违法行为，依法履行纳税义务，避免因没有遵循税法可能遭受的法律制裁、财务损失或声誉损害。
企业怎样搭建全面税务风险管理体系构建企业税务风险管理体系的具体途径：
（一）构建企业税务风险管理体系的理论基础
企业税务风险不仅有内部和外部的原因，也有主观和客观的原因，因此要解决一系列企业风险问题，要求企业必须把握构建企业税务风险管理体系的理论基础，如全面风险理论，全面风险管理理论主要由内部环境、目标设定、事项识别、风险评估、风险应对、控制策略、信息沟通、问题监察等八个部分组成，税务风险管理应以此为理论基础，详细的了解企业税务风险管理的流程和方法，及时准确的编制企业适用的税法规范制度并不断更新；建立及完善健全的税务风险管理体系及更新系统，保障企业税务管理系统与国家法律规范的标准保持一致，以此来构建科学的、全面的企业税务风险管理体系，从而实现企业科学、有效且全面的税务风险管理。
（二）制定风险控制流程，设置风险控制点
我国税务局颁布的《大企业税务风险指引》的文献，其中明确指出了企业税务风险管理的目标，并且为一些具体的税务风险问题提出了解决方案和措施，不仅为企业税务风险管理指明了方向，同时也使得企业税务风险管理提供了政策依据。企业应该在围绕《指引》展开一系列企业税务风险管理工作，设置税务风险控制点，采取人工控制机制或自动化控制机制，建立预防性控制与发现性控制机制。针对重大税务风险所涉及的管理职责与业务流程，制定覆盖各环节的全流程控制措施；对其他风险所涉及的业务流程，合理设置关键控制环节，采取相应的控制措施；协同相关职能部门，管理日常经营活动中的税务风险，联系企业具体实际情况，制定出科学合理的，适合企业发展的税务风险管理制度，并且严格落实制度具体方案，最大限度的控制企业的税务风险，杜绝企业偷税漏税等违法行为，促进企业税务风险管理体系的构建。
（三）遵循构建企业税务风险管理体系的特殊原则
企业税务风险管理体系的构建要求企业必须遵循及时准确申报、按时缴纳、绝不拖欠的特殊原则，坚决履行企业纳税任务，尽可能的降低企业税务风险对企业正常运作的影响。除此之外，构建企业税务风险管理体系要求企业还用遵循成本效益、全面性、可操作性、目标导向性以及有效性等原则，帮助企业成功化解各种税务问题，并且为企业税务风险管理提供指引，从而促进企业税务风险管理体系的构建。
（四）提高税务风管理人员对税务风险管理的认识
企业税务风险管理人员普遍风险意识薄弱，这也是制约企业税务风险管理发展的一大问题，作为税务风险管理的主心骨，不仅要不断提升自身综合素质及专业水平，同时也要不断提高自己的风险意识，才能有效地促进企业税务风险管理的发展，避免出现因为“谋私利”、“中饱私囊”等的现象。同时增强对风险的预知能力，最大限度的降低税务风险带给企业的损失。提高税务风险管理人员的综合素质不仅要求相关税务风险管理人员对自身严格要求不断进步，同时企业uing为其提供一定的条件，提供各种各样的学习渠道和方式，才能从根本上构建出一支高素质的税务风险管理人员队伍，进而推动企业的进一步发展。
（五）规划税务风险应对策略
税务风险对企业造成的影响可大可小，企业对风险的应对也有多种策略，可分为可接受、逃避、转移、小心管理等。因此，在处理税务风险上可按照税务风险的危害程度来选择应对策略，对于比较容易发生且风险影响大的风险尽可能的避免；对于比较容易发生但危害程度小的可选择转移；对于发生几率小危害程度也小的风险可选择小心管理的策略，尽量控制风险使其合理化；对于发生几率和危害程度都小的风险，就可以选择可接受，适当适量的风险反而有利于推动企业的发展。