目前跨境电商企业会涉及的税务风险如下：
有很多跨境电商企业由于没有采购发票及出口资质，便没有通过自有公司报关出口，而是通过货代或者是物流商买单报关出口，但 买单报关是违法行为，其违法性主要表现在走私、避税和外汇这些方面。
再者，报关行以及货代公司为您提供买单报关服务的同时，可能也在进行配票配货的虚假出口业务，如果您的 货物被拿去骗税 ，那您可能在无形中被牵涉到，可能面临严重的 骗税刑事责任风险 ：以假报出口或者其他欺骗手段，骗取国家出口退税款，数额较大的， 处五年以下有期徒刑或者拘役，并处骗取税款一倍以上五倍以下罚金;数额巨大或者有其他严重情节的，处五年以上十年以下有期徒刑，并处骗取税款一倍以上五倍以下罚金。
目前部分跨境电商为了逃避高额税负，通过第三方支付机构收汇到境内个人账户，规避企业所得税。这种做法是典型的偷税行为， 未来会面临很大的税务风险， 且个人账户频繁交易或者有大额交易，会被银行列入重点监控对象， 资金账户也有可能会被银行冻结 。也就是说， 收汇到个人银行账户，不仅可能会被银行冻结资金，且会存在巨大的税务风险 ，真的是得不偿失啊。
未税收入直接转到个人账户，如果被税务局认定为个人收入，按综合所得去纳税，税率最高为45%，税负极高！如果是正规收汇到公司对公账户，还可以享受小微企业税收优惠。
企业作为扣缴义务人，未履行代扣代缴员工个人所得税义务的，存在着不小的 税务风险 。如果企业被税务局核查到未代扣代缴税款，按照《税收征收管理法》第六十九条规定， 扣缴义务人应扣未扣、应收而不收税款的，由税务机关向纳税人追缴税款，对 扣缴义务人处应扣未扣、应收未收税款百分之五十以上三倍以下的罚款。
虽然纳税义务人是员工，税务机关是向取得收入的个人纳税人追缴税款，但企业作为扣缴义务人，没有履行义务，也会被处以罚款。
最近这几年，国家税务局打击偷税漏税的行动极大，谁知道哪天会不会就轮到了跨境电商呢?
大数据时代，企业经营尤其是电商企业经营会留下大量的数据信息， 跨境电商企业的经营状况在线上就可以查证 。税务部门只需要在跨境电商平台上开展调查，直接对相关店铺进行取证，就可以形成一条完整的证据链。
税务稽查风口上，唯有合规经营才能使企业 健康 发展。
企业外部税务风险的因素包括企业外部税务风险的因素包括：经济形势和产业政策、适用的法律法规和监管要求、市场竞争和融资环境、税收法规或地方法规的适用性与完整性、行业惯例、上级或股东的越权及违规行为等。
其中，企业税务风险是企业的涉税行为因未能正确有效遵守税收法规而导致企业未来利益的可能损失。
为了避免企业税务风险的发生，企业应健全和完善内控和税务代理制度，构建税务风险预测系统，明确纳税人的权利、正确评价并适时监控税务风险。
跨境电商企业的店铺公司，长期零申报会有哪些税务风险？跨境电商卖家朋友们注册的大多数公司，都只是为了注册开设店铺用的，这些店铺公司基本不会用于实际经营，因此会长期进行零申报，但长期零申报是不可取的，会有税务风险！
一般来说，零申报 超过三个月甚至半年以上 会被税务机关认定为“长期”，但这个问题没有具体的定义，具体的时限要以各个地区税务机关认定的为准。
长期零申报的企业会被税务机关纳入重点监控名单，被纳入监控范围后，税务机关会进行相应的纳税评估，后期有可能会被税务局进行 税务稽查 ，如果核查被发现隐瞒虚报，会被要求补缴税款和滞纳金；
如果连续3个月或者累计6个月进行零申报的， 纳税信用等级评分会降低 ，没办法评为A级纳税人；
有的地区税务机关核查较为严格，如果企业一直进行零申报，后续企业要进行注销， 专管员不会同意注销申请，会进行核查，有可能让企业补税后才予以注销 ；
如果企业有申请了发票，长期进行零申报， 发票数量以及版位会被税务机关降低 ；
税务机关可以通过对企业进行核查，要求企业按照 相关规定采用成本费用公式去核定收入缴纳税金；
如果企业长期进行零申报，有可能 被税务机关纳入“走逃户” ，纳入走逃户 会被纳入重大失信黑名单且对外公告 ，还会被评为D级纳税人。
正常来说，开立一家企业是以盈利为目的的，如果一家企业长期零申报没有任何收入来源，那这家企业是不可能会存续太久的，公司运营是需要成本的，基本的租金水电费以及人工工资费用支出是少不了的，没有人会一直做亏本买卖，这种 不合常理的存续企业势必会引起关注。
如果企业在 筹建期或者存在经营不善、依法被关停等情况 是不用纳入重点监控范围的，但是必须要 及时前往税务机关进行备案 。
可以利用 税收优惠政策申报些免税收入 （如小规模季度不超过45万的免税收入），申报法人的工资，然后对应缴纳法人的社保，不要让企业被列入重点监控名单，特别是主要的店铺公司一定要进行维护！
如果长期零申报，一定要建立账本！一旦被税务稽查，会要求提供凭证、账本、财务报表。