企业先注册账户，登陆自然人申报管理系统，在页面的上方选择生产经营所得申报，然后进入生产经营所得税纳税申报表，按照收入成本费用相关的项目填写有限合伙企业的个人，需要交纳生产经营所得个人所得税，该税种在自然人申报管理系统里面进行申报。
其操作流程为，企业先注册账户，登陆自然人申报管理系统，在页面的上方选择生产经营所得申报，然后进入生产经营所得税纳税申报表，按照收入成本费用相关的项目填写，会自动计算出应纳税所得额，提交申报，并扣缴对应的税额即可。
合伙企业个人经营所得税怎么申报实行核定征收个人所得税的投资者，由投资者在每季度终了后15日内及年度终了后30日内向主管税务机关报送《核定征收个人独资企业和合伙企业投资者个人所得税年度（季度）申报表》并缴纳个人所得税。
实行查帐征收投资者缴纳的个人所得税，按年计算，分季预缴，由投资者在每季度终了后15日内预缴，并向主管税务机关报送《查帐征收个人独资企业和合伙企业投资者个人所得税年度(季度)申报表》。
年度终了后3个月内汇算清缴，多退少补，同时向主管税务机关报送《查帐征收个人独资企业和合伙企业投资者个人所得税年度（季度）申报表》，并附送年度会计决算报表和预缴个人所得税纳税凭证。
法律依据《中华人民共和国企业所得税法》第五条 企业每一纳税年度的收入总额，减除不征税收入、免税收入、各项扣除以及允许弥补的以前年度亏损后的余额，为应纳税所得额。
企业以货币形式和非货币形式从各种来源取得的收入，为收入总额。
包括：（一）销售货物收入；（二）提供劳务收入；（三）转让财产收入；（四）股息、红利等权益性投资收益；（五）利息收入；（六）租金收入；（七）特许权使用费收入；（八）接受捐赠收入；（九）其他收入。
合伙企业怎么交税(一)合伙企业的合伙人以合伙企业的生产经营所得和其他所得，按照合伙协议约定的分配比例确定应纳税所得额。
(二)合伙协议未约定或者约定不明确的，以全部生产经营所得和其他所得，按照合伙人协商决定的分配比例确定应纳税所得额。
(三)协商不成的，以全部生产经营所得和其他所得，按照合伙人实缴出资比例确定应纳税所得额。
(四)无法确定出资比例的，以全部生产经营所得和其他所得，按照合伙人数量平均计算每个合伙人的应纳税所得额。合伙协议不得约定将全部利润分配给部分合伙人。
合伙企业的合伙人是法人或者其他组织的，合伙人在计算其缴纳企业所得税时，不得用合伙企业的亏损抵减其盈利。
法律依据：《财政部、国家税务总局关于合伙企业的
合伙企业税务登记流程法律主观：1、对于普通 合伙企业 就是指的这其中的 合伙人 是普通合伙人组成的。而 有限合伙企业 则有所不同，有限合伙企业的合伙人将会按照合伙人对合伙企业承担的责任不同来把其中的合伙人划分为普通合伙人还有 有限合伙人 ，那么既然是两种合伙人所以他们对与企业所负责的事务也有所不同，有限合伙人不需要执行合伙企业事务，而普通合伙人将会执行合伙企业的事务。关于具体的合伙人，他们可以是自然人，也可以是法人或是其他的组织，而既然是合伙企业那么就会产生相应的问题，其中合伙企业的纳税就是一个重要的方面。 2、在合伙企业的所得分配上面，根据我们国家的相关税法指出，合伙企业的合伙人将会按照一定的原则和比例分配应纳税所得额。具体的分配原则就有合伙企业的合伙人根据合伙企业的生产经营所得还有其他的经营所得，按照进行合伙经营时的约定根据一定的比例分配应纳税所得额;如果有前期签订的合伙经营协定中没有明确如何分配应纳税所得额的情况，那将会按照合伙企业的全部生产经营所得还有其他经营所得，再根据合伙人的共同协商决定分配的比例确定应纳税所得额;如果协商不成功的情况下，将会继续根据合伙企业的全部生产经营所得还有其他的经营所得，再根据实际的合伙人对于合伙企业的出资比例来确定应纳税所得额;最后如果上述的条件还没有成立的情况下，也就是没有办法确定实际的出资比例的时候，还是按照合伙企业的全部生产经营所得还有其他经营所得，根据合伙企业合伙人的人数平均的计算每一个合伙人的应纳税所得额。 3、对于合伙的企业来讲，企业并不是所得税的纳税义务人，而是以合伙企业中的每一个合伙人来作为纳税义务人，其中的合伙人作为自然人应当缴纳 个人所得税 ;如果合伙人是法人或者是其他的组织的情况下，缴纳企业的所得税。 4、对于合伙企业的纳税还要遵循的一个原则那就是先分后税的原则，也就是要先计算好每一个合伙人根据比例分配的应纳税所得额再进行交税。关于合伙企业拿出来分配的生产经营所得还有其他的所得，包括的是企业分配给所有合伙人所得还有当年企业的留存利润，而不包括合伙企业对外的投资所得到的相关的利息、股息的回报。还有对于个人合伙人将会按照分配的比例计算所得额，再查看应该交税的项目，适用于百分之五到百分之三十五的五级超额累进税率来计算个人的所得税。 不算是合作类型的企业，还是 有限责任公司 ，一旦已经注册成功，其他的法人也可以成为公司的股东。对于有法人、自然人等合伙注册的公司，在经营期间，需要由给股东按照比例，支付税额。纳税前还需要先确定合伙企业目前的经济活动情况，否则无法确定具体的纳税金额。