发票作废的具体操作流程为：1、作废增值税专用发票最重要的是在开票系统里作废，在发票填开窗口里有个发票作废一栏，单点需要作废的发票，将其点成深色，再点击下面的作废按钮，这张发票就在税务系统里作废了，这才叫真正的作废，就可以不用上税了。
然后再对纸质发票作废，这就是次要的了，如果单位有作废章，盖作废章看起来正规点，如果单位没有作废章，就直接用笔写在发票上（发票自带复写，每一张都作废了），然后将作废的三联发票保管好，留单位备查就行了。
作废发票必须是当月的发票，如果跨月的发票，是不可能作废的（金税系统里是不认可的），只能采取开红字的方式冲掉该发票（开红冲发票有专门的手续）。
【法律依据】：《关于修订增值税专用发票使用规定的通知》 第十三条 一般纳税人在开具专用发票当月，发生销货退回、开票有误等情形，收到退回的发票联、抵扣联符合作废条件的，按作废处理；开具时发现有误的，可即时作废。
作废专用发票须在防伪税控系统中将相应的数据电文按“作废”处理，在纸质专用发票（含未打印的专用发票）各联次上注明“作废”字样，全联次留存。
《关于修订增值税专用发票使用规定的通知》第十四条 一般纳税人取得专用发票后，发生销货退回、开票有误等情形但不符合作废条件的，或者因销货部分退回及发生销售折让的，购买方应向主管税务机关填报《开具红字增值税专用发票申请单》（以下简称《申请单》，附件3）。
《申请单》所对应的蓝字专用发票应经税务机关认证。
经认证结果为“认证相符”并且已经抵扣增值税进项税额的，一般纳税人在填报《申请单》时不填写相对应的蓝字专用发票信息。
经认证结果为“纳税人识别号认证不符”、“专用发票代码、号码认证不符”的，一般纳税人在填报《申请单》时应填写相对应的蓝字专用发票信息。
发票作废怎么操作已经开出来的发票，有时会因为某个小细节没注意，有时甚至是客户提供的信息不够准确，需要作废后重新开具。
当月开出的发票可用“作废”来处理；若是跨月的发票，得用“红字发票”来冲抵了（链接）。本篇就来介绍如何作废发票。
工具／原料：电脑、网络、开票系统，金税盘
确保电脑网络通畅，将金税盘连接电脑，以开票员账号登录开票系统，详细过程可下面的链接。
点击“发票管理”，再点击“作废发票”按钮。
此时系统会跳出所有开票信息的清单界面，找出需要作废的那条发票信息，选中后点击鼠标打开。
此时系统跳出当时开具的发票信息，点击上面的“作废”按钮。
按系统提示，对该发票进行作废操作。最后一步为检查确认，再回到所有发票的清单中，查看作废标志。
纸质发票作废怎么操作纸质发票作废操作手续如下：1、确保电脑网络通畅，将金税盘连接电脑，以开票员账号登录开票系统。
点击“发票管理”，再点击“作废发票”按钮。
此时系统会跳出所有开票信息的清单界面，找出需要作废的那条发票信息，选中后点击鼠标打开。
此时系统跳出当时开具的发票信息，点击上面的“作废”按钮。
按系统提示，对该发票进行作废操作。
最后一步为检查确认，再回到所有发票的清单中，查看作废标志。
找税务厅代开发票具体方法如下：1、到主管国税局办税服务大厅领取并填写《代开发票申请表》一份2、纳税人应提供资料：申请代开发票人的合法身份证件，付款方对所购物品品名、单价、金额等出具的书面确认证明，或购销合。
税务机关承诺时限：提供的资料完整、填写内容准确、各项手续齐全的，当场办结。
发票作废时间：开出的发票作废最长是一个月。
开出的发票作废，必须在开票当月。
跨月不能作废，只可以冲红票。
普通发票的红字发票开票只要对方将原发票予以退回，即可开具，但专用发票的红字发票开具较为复杂。
具体分二种情况：1、如果该发票购货方已经通过认证并抵扣的，则由购货方向主管税务机关申请开具红字发票通知书，销售方凭该通知书开具红字发票；2、如果购货方未将该发票进行认证的，则由销售方向主管税务机关申请开具红字发票通知书，销售方凭该通知书开具红字发票。
法律依据：《中华人民共和国发票管理办法实施细则》第二十七条 开具发票后，如发生销货退回需开红字发票的，必须收回原发票并注明“作废”字样或取得对方有效证明。
开具发票后，如发生销售折让的，必须在收回原发票并注明“作废”字样后重新开具销售发票或取得对方有效证明后开具红字发票。