医保个人账户余额为零，可能存在以下原因：
缴纳社保只参保了养老保险，没有购买医疗保险。比如，以灵活就业形势缴纳社保是可以只选择参保养老保险，很多人为了能够领取养老金，并同时减轻社保负担，没有选择购买医疗保险。虽然参保养老保险也有社保卡，但是没有购买医疗保险，自然我们医保账户余额就会为零。
参保人缴纳的社保并非是我们所说的城镇职工社会保险，而是城乡居民社会保险。参保职工社保的，在医疗保险这一险种中。每个月单位缴纳8%，个人缴纳2%。单位缴纳的部分就进入了统筹账户，个人缴纳的部分进入个人账户，如果参保居民社保，那就不存在医保个人账户，账户余额自然会为零。
参保人是以灵活就业形势缴纳社保，如果参保的是城镇职工社保，同时，也有缴纳医疗保险，但个人医疗保险账户也依然会有为“0”，原因可能在于参保人是以灵活就业形势缴纳社保，在医疗保险缴费上选择的是4%的缴费比例而不是8%，但医保的缴费上，若选择4%这档缴纳的话，那么就不会设立个人账户。选择8%这档我们才会拥有个人医保账户。既然个人账户都没有了，自然余额会显示为零。