企业所得税存在成本费用大于发票的税务风险应对的方法如下：1、企业要补缴税款，认真核查财务账目，彻底剔除“偷税漏税”行为，加强财务审计，密切监控税收缴纳情况，以避免企业被税务机关查处的风险。
企业应当重视税务局的信息报送工作，准确报送发票信息、进出口信息等，以及建立税收成本关系，并定期进行抽查核查的工作，以期税务申报和征税规则的完整及时遵守。
会计知识：营业成本大于营业收入会出现税务风险吗？公司的存在就是为了盈利，如果成本大于收入，那么明显就意味着企业亏本了，那么亏本的企业会不会出现税务风险呢？什么是税务风险呢？和小编一起来看看吧。
（一）什么是税务风险？税务风险一般包括两方面，一方面是企业少纳税少缴税，不符合税收法律的规定，要面临补税加收滞纳金以及公司声誉损害的一些风险，另一方面是企业经营行为的税法不准确，少用了一些税收优惠的政策条件，出现了多纳税和承担了一些不必要的税收负担等。
（二）营业成本大于营业收入会出现税务风险吗？如果长时间的出现营业成本大于营业收入的情况，那么税务部门是会介入调查的，如果在税务方面出现问题时，要主动说明企业的生产经营情况，是为什么会出现这样的问题，做一个情况说明，如果没有主动的去说明，那么等到税务部门约谈法人的时候，情况就会更糟糕一点。
（三）出现税务风险，应该怎么做？1、每月去税务局纳税申报；2、报送会计报表，也可以按季度来报送；3、税务部门会排工作人员对公司的情况进行评估，评估结束后，还会提出相应的评估建议，如果发现情况不实，或者是需要补税，那就需要纳税人主动一点，把税款交齐，如果出现情况后，需要补税，但是纳税人不补税，又不说明理由的，或者是理由被驳回的，就会提交到稽查局作为重点稽查的对象了。
收入高,成本低,费用高有风险吗收入高成本低费用高有风险。
根据相关信息查询。
每个月，企业需要到税务局完成纳税申报，同时提交相应的会计报表(按季)，无需单独备案。
但税务局会根据企业情况安排相应人员进行纳税评估，并给出一些评估建议。
如发现不实，将要求企业纳税。
企业不改正的，不予纳税，也不说明理由和情节，或者理由不充分。
然后税务局会提交给稽查局对企业进行重点检查。
综上所述，如果的成本低收入高，就会存在税收风险。