自然人股东是相对法人股东而言的，是具有公民身份的个人投资者，在他进行公司的投资以后通过公司所在地的工商局注册，进行公司股权登记，就成为自然人股东。
自然人是基于自然出生而依法在民事上享有权利和承担义务的个人。股东是股份制企业的出资人或叫投资人。
非自然人股东是参与公司投资的企业法人，比如A公司投资于B公司，成为B公司的非自然人股东，区别在于一个是具有公民身份的个人；一个是企业法人（经济组织）。作为自然人股东，依据《中华人民共和国个人所得税法》及其实施条例的规定，自然人股权转让行为，转让方需要按“财产转让所得”计征个人所得税。
即：以转让股权的收入额减除原值和合理费用后的余额，适用百分之二十的比例税率，计算缴纳个人所得税。
但是，如果转让方以原价转让的，不交个人所得税。