个人所得税零申报流程：1、打开自然人税收管理系统，选择自己的企业，点击进入；2、进入到自然人税收管理系统界面后，点击综合所得申报；3、页面跳转，找到正常工资薪金所得，点击后面的填写；4、进入填写界面后，选择生成零工资记录，之后点击立即生成数据；5、数据生成之后，页面会弹出已生成某年某月的工资，点击确定；6、确定之后，就可以看到，零个税的工资表了，点击发送申报就可以了。
个人所得税的征税内容：1、工资、薪金所得；2、个体工商户的生产、经营所得；3、对企事业单位的承包经营、承租经营所得；4、劳务报酬所得；5、稿酬所得；6、特许权使用费所得；7、利息、股息、红利所得；8、财产租赁所得；9、财产转让所得；10、偶然所得。
综上所述，个人所得税零申报，找到当地的税务局官方网站，在网站中下载工资薪金个人所得税申报表，根据相关内容填写纳税申报表，申报表填写完毕之后点击保存，点击扣缴个人所得税模块，上传已填好的纳税申报表。
【法律依据】：《中华人民共和国税收征收管理法实施细则》 第十三条 扣缴义务人应当自扣缴义务发生之日起30日内，向所在地的主管税务机关申报办理扣缴税款登记，领取扣缴税款登记证件；税务机关对已办理税务登记的扣缴义务人，可以只在其税务登记证件上登记扣缴税款事项，不再发给扣缴税款登记证件。
个税零申报怎么操作个税零申报指的是纳税申报的所属期内没有发生应当需要缴纳税收的收入，并且也没有应纳税额产生，这种就叫做零申报。在税务机关办理税务登记的纳税人、扣缴义务人当期没有发生任何税收行为时，同样需要向税务机关办理零申报手续，并且需要在申报时注明当期没有应税事项，具体申报流程如下：
【1】登录国家税务总局官网下载自然人电子税务局扣缴端安装好之后，注册并登录;
【2】选择左边人员信息采集后添加，然后根据页面内容输入自己的准确信息，如果没有员工输入法人的也可以，任职日期填上个月的1号(如以前添加过则跳过此步骤);
【3】信息填写完整之后点击报送，然后查看下状态验证是否通过;
【4】选择左边的综合所得税申报，右边正常工资薪金所得后面点填写，界面中弹出数据后点击确定即可;
【5】选择左边综合所得申报，再点击右边2税款计算，系统会自动计算出金额;
【6】点击申报之后，选择获取反馈，如申报状态显示成功，那么就无须缴款，如显示有税则需要点击左边的税控缴纳，按照步骤提示进行个税扣缴。
以上就是关于个税零申报的全部步骤，个税零申报同样需要进行纳税登记，个税为零填写时填0即可。
个税零申报怎么操作在电脑上登录“自然人税收管理系统扣缴客户端”，使用密码登录。
初次使用需下载注。
然后，在打开的界面中，选择“人员信息采集”，将需要填报的人员录入。
已经录入的这个步骤就不需要了。
然后，打开“综合所得申报”，点击“正常工资薪金所得”后的“填写”，进行填报。
个税零申报包含两种：一种是收入为0，一种收入不为0，但扣除费用后金额低于起征点。
这里需要按实填报，收入是0就在本期收入下填0，不为0的也要据实填写。
缴纳社保和公积金的，这里也要填写，如工资为0，但公司给交社保，这时候的工资收入就不能填0，需要填入社保个人部分。
填写完成后，点击“返回”，在“综合所得申报”主界面，依次点击“税款计算”、“附表填写”、“申报表报送” 7、申报完成后，如果不能看到结果，点击“获取反馈”，看到左边的申报状态为“申报成功”，申报工作就完成了。