在大众创新，万众创业的时代，设立公司还是很容易的。但是，不是所有的公司都可以获得成功。创业公司倒闭的概率还是很大的。
公司在运行的时候，如果存在一些不合规的问题，公司在注销的时候，也会遇到困难。
企业注销需要注意哪些税务问题?
存货问题
企业在注销时，如果账上还是货，也是需要缴纳增值税的。另外，即使账上没有货了，但是实际存在库存的，也需要视同销售缴纳增值税、企业所得税。
印花税
印花税的金额虽然不大，但是企业忽略的情况比较普遍。企业在注销以前，一定要自查一下，印花税相关事项。
有的企业可能在营业期间，一直都没有缴纳过印花税。企业的这些“病”，都会在注销的时候显现出来!
个人所得税
在个税方面，要看一下企业是不是存在股东借款不还的情况。如果存在股东借款不还的情况，需要按照分红处理。同时需要为股东，代扣代缴个人所得税。
企业注销时，如果处理账上的实际存货?
企业在注销的时候，还有货存在，肯定是大概率事件。这个时候，企业肯定需要把这些货分给股东。
但是，企业不是直接给股东就可以了。《增值税暂行条例实施细则》里面明确规定，企业在把商品分给股东的情况，属于视同销售的情况。意思就是说，这个货虽然分给股东，也需要按照市场价格计算增值税。
账面大于库存怎么处理?
如果金额小还好说，如果金额大了，企业需要补交的税款也是一笔不小的费用。
之所以出现这样的情况，是因为企业存在一些未开票收入。所以这部分存货，不仅需要视同销售缴纳增值税，同样也需要缴纳企业所得税。如果情况严重，企业还需要缴纳罚款和滞纳金。
所以，企业在平时的时候，就需要按时核对一下相关账目。发现账实不符的时候，一定要及时处理，而不要把这些问题累积起来，到注销的时候，才去处理。
货物因自然灾害损坏了，怎么处理?
在大自然面，我们也是很无能为力。企业的货物如果是被自然灾害损坏的，是可以按照意外损失处理的。
如果企业当时未处理，现在就需要提供相关资料了。如果企业没有证据可以证明，那么企业就需要把进项税额进行转出处理了。
公司注销后有税务问题如何处理法律主观：公司经营就离不来经济往来相关活动，因此免不了就会涉及到一些税务上问题。但一般收税纳税都是公司发展中一笔不小的经济压力，但不可避免就算是公司要注销，也是需要办理好税务上的问题。一、公司注销要处理那些税务问题1、印花税在企业注销的时候，却显得非常重要，该补的要赶紧补齐。因为有关企业的重大合同，均会进行印花税审核。实收资本、资本公积、营业账簿、租赁、购销合同都要检查。2、账面存货要交税账面存货一般会出现在商贸批发行业中的企业。比如说，某商贸批发企业，不想继续经营了，准备进行注销，账面上还有存货，则会分配给股东或者投资者，作为出资的收回或者利润的分配。3、账面库存大于实物库存往往注销企业出现账面库存大于实物库存的原因，是因为商品销售后漏报了收入而导致的。可能出现在公司注销时，账面上有库存，但实际上仓库里面什么都没有了的情况。而出现这种状况，税务实地核查后，轻则按视同销售来处理，重则需要补交滞纳金。4、库存坏了针对食品销售公司，在注销时，例如，仓库中有150万元（含税）的食品因管理不善而导致过期，发票已经认证抵扣了。虽然账面上这150万元确实不值钱，但是根据增值税管理办法，因管理不善造成的损失，之前做了进项抵扣的必须进项转出。二、公司注销税务处理方式1、公司注销如果是地税共管户，那么一般纳税人首先就应该办理国税注销登记，注销登记办理好了之后自取处理地税注销登记。2、登记地税和国税纳税人还需要填写《注销税务登记申请表》，并到主管区局申请清缴发票和清缴税款。3、纳税人办理清缴发票和清缴税款之后，持《注销税务登记表》前往主管区局或者是主管税务办事处的综合服务窗口办理注销。4、税务人员录入注销税务登记受理信息，并向纳税人发放受理回执。同时主管税务机关需要对纳税人实施注销税务稽查(核准)。5、纳税人凭主管税务机关实施注销税务稽查(核准)后加盖同意注销意见的《注销税务登记申请表》、原注销受理回执及税务登记证到主管区局或主管税务所的综合服务窗口办理注销核准手续。6、税务人员的受理纳税人的注销核准申请后，收回纳税人的税务登记证件正、副本并为纳税人开具《注销税务登记通知书》。三、注销税务登记的期限1、纳税人发生解散、破产、撤销以及其他情形，依法终止纳税义务的，应当在向工商行政管理机关或者其他机关办理注销登记前，持有关证件向原税务登记机关申报办理注销税务登记；按照规定不需要在工商行政管理机关或者其他机关办理注册登记的，应当自有关机关批准或者宣告终止之日起15日内，持有关证件向原税务登记机关申报办理注销税务登记。2、纳税人因住所、经营地点变动而涉及改变税务登记机关的，应当在向工商行政管理机关或者其他机关申请办理变更或注销登记前或者住所、经营地点变动前，向原税务登记机关申报办理注销税务登记，并在30日内向迁达地税务机关申报办理税务登记。3、纳税人被工商行政管理机关吊销营业执照或者被其他机关予以撤销登记的，应当自营业执照被吊销或者被撤销登记之日起15日内，向原税务登记机关申报办理注销税务登记。
法律客观：《中华人民共和国市场主体登记管理条例实施细则》第四十六条申请办理注销登记，应当提交下列材料：（一）申请书；（二）依法作出解散、注销的决议或者决定，或者被行政机关吊销营业执照、责令关闭、撤销的文件；（三）清算报告、负责清理债权债务的文件或者清理债务完结的证明；（四）税务部门出具的清税证明。除前款规定外，人民法院指定清算人、破产管理人进行清算的，应当提交人民法院指定证明；合伙企业分支机构申请注销登记，还应当提交全体合伙人签署的注销分支机构决定书。个体工商户申请注销登记的，无需提交第二项、第三项材料；因合并、分立而申请市场主体注销登记的，无需提交第三项材料。
公司注销时需要注意哪些税务问题?公司会由于各种原因可能经营不下去而倒闭，公司倒闭有两种方法，一种是转让公司，另一种就是注销公司，如果选择注销那就需要把税务方面的问题解决了，比如要去清税，没有交的税需要补交，欠下的税款也需要。如果没有及时或拒不缴纳欠税的话，将收到法律的制裁，因此，公司若是要注销的话一定要记得清税。
公司注销税务期间，主要有以下涉税事项：
流转税
清算期间，企业往往会有存货、固定资产等交易行为，包括直接销售或转让、资产分配两种。对于资产的直接销售和转让行为，企业在清算期间要将其视为正常的货物销售行为，要按照和所得税的纳税要求来及时缴纳税金，对于企业的不动产，纳税应该由购买方承担，该项税额可以进行适当的转移。资产分配，即注销企业资产直接分配个股东或投资者，纳税人资产进行分配的，都应当按照视同销售进行税务处理。
所得税
所得税是企业开展日常经营管理工作时必须要缴纳的税种之一，是企业在清算期间结束经营业务之后，对企业自身的剩余财产和债务分配进行清算，并对自己的经济行为进行所得清算、分配企业的股息;根据，企业清算期间所得税处理主要包括：可向股东分配的剩余财产、应付股息;确认债权、清偿债务所得或损失;处理预提、待摊费用;弥补亏损，确认清算所得;全部资产按变现价值或价格，确认资产转让所得及损失等。其中，清算所得的计算为资产处置损益减去清算费用、税金及附加、债务清偿损益、往期亏损及其他所得或支出，即为清算所得。
其他税类
其他税类主要包括清算中房屋租赁税、印花税、各种欠税和罚款等。这类税种对企业的经营发展具有重要的作用，企业在清算期间要重视其他类税种对企业清算工作的影响。
房屋租赁税
一般来说，房屋租赁税是公司注册地址的房东向接到每月缴纳的，因此在注销公司的时候要跟房东确定其是否有按时缴纳房屋租赁税，如果没有的话，就需要到地税补交(从租赁起到终止)按照租金的12%缴纳。
印花税
根据规定公司注销了，需要检查公司实际缴纳出资，印花税需要按照实际出资金额进行缴纳，如果没有实际缴纳注册资本的话就不要缴纳印花税。
各种欠税和罚款
欠税和罚款没有缴清的话是不能直接注销的。根据《公司法》的，公司注销清算组应主动对企业申报的欠税情况进行全面清查，核实欠税是否属实，对企业欠税在清偿过程中优先清偿，避免税收流失。《企业所得税法》，企业在年度中间终止经营的，应自实际经营终止之日起60日内向税务机关办理当期企业所得税汇算清缴。企业在注销前，清算所得并向税务机关申报缴纳企业所得税。
公司注销光是税务注销这一项就够大家忙一段时间了，税务注销属于公司注销整个流程里面比较麻烦的了，很多企业办理注销难就难在了税务注销上面，公司越大规模越大成立时间越长可能税务注销就越难。