严格来说，印花税是按合同金额征收的，即签定建筑安装工程承包合同时，按合同所载金额，缴纳万分之三的印花税。也就是说，工程竣工决算金额如果超出原合同金额，如果未补签合同，是不需要补缴印花税的。
查账征收的企业所得税是在会计利润基础上，按照税法规定进行部分调整后征收的，企业收入减成本、费用、税金等有余额的，就按余额的25%缴纳企业所得税。但目前很多建筑企业是核定征收企业所得税的，这样，税务机关一般是按工程收入依一定比例直接计算征收企业所得税，所以，拿到进度款和决算余款，都需要按申请开发票的进度款或决算余款依这个比例直接缴纳企业所得税。
建筑企业缴纳的个人所得税，一般包括两部分，一是员工的工资薪金个人所得税，也即超过3500元的员工需要由建筑企业代扣个人所得税向地税机关申报缴纳；二是目前建筑企业90%以上都是实行项目经理人承包或挂靠经营模式的，很多地方的地税机关会对项目经理人或承包人、挂靠人依一定比例征收“对企事业单位的承包承租经营”个人所得税。这个和对建筑企业征收的企业所得税是两回事。
工程结算超出合同价怎么处理法律分析：工程结算超出合同约定的价格，要根据实际施工的情况分析。
当事人对建设工程的计价标准或者计价方法有约定的，按照约定结算工程价款。
因设计变更导致建设工程的工程量或者质量标准发生变化，当事人对该部分工程价款不能协商一致的，可以参照签订建设工程施工合同时当地建设行政主管部门发布的计价方法或者计价标准结算工程价款。
当事人就同一建设工程另行订立的建设工程施工合同与经过备案的中标合同实质性内容不一致的，应当以备案的中标合同作为结算工程价款的根据。
法律依据：《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》 第十九条 当事人对工程量有争议的，按照施工过程中形成的签证等书面文件确认。承包人能够证明发包人同意其施工，但未能提供签证文件证明工程量发生的，可以按照当事人提供的其他证据确认实际发生的工程量。
结算审计超出合同价怎么办建议协商解决，协商无果，可以起诉违约合。
首先要看看合同是固定单价合同还是固定总价合。
如果是固定总价合同，那么一般不调整签约合同价。
如果是固定单价合同，根据相关法律规定还需要看合同中价格变更和风险约定的条款。
工程结算时，超出合同约定的，如果合同对处理有约定的，按约定处理，没有约定的，双方可以协商处理，也可以按签订合同所在地建设行政主管部门发布的计价方法或者计价标准结算工程价款。
当事人在建设工程施工合同专用条款或另行签订的协议中明确约定发包人应在收到承包人提交竣工结算文件后一定期限内予以答复，且逾期未答复则视为认可竣工结算文件的，承包人依据规定请求按照竣工结算文件结算工程价款的，应予支持。
没有明确约定逾期未答复则视为认可竣工结算文件的，承包人请求按照竣工结算文件确定工程价款的，不予支持。
建筑工程结算流程注意事项1、核对与编制好结算资料基础。
任何一个工程项目，在编制结算时都要以相关资料依为依据。
工程量是审核的关键。
工程量费用是工程造价的主体。
运作中具有较大的弹性和隐蔽性。
审核工程量是重点，也是难点。
定额单价的审核不可忽视。
在一般情况下，工程的定额单价都有具体规定，编制工程结算时只要参照定额单价的明细子目直接就可以套用。
然而在实际操作中，定额单价套用往往出现差错。
其他费用的审核坚持合情合理。
其他费用，由于计算方法不同于工程量和定额单价的套用，故在审核中要根据费用的发生具体对待。
工程结算审计收费标准1、工程造价审计收费通常采用基本收费+追加收费两部分组成，基本收费一般定为建设单位送审总造价的0.1--0.3%左右，追加收费一般定为中价机构审减金额的4--9%左右。
审计服务费用由建设单位支付，在工程投资中单独列支（国家财务部有相关规定）。
基本建设财务管理规定中第十九条明确规定，建设工程待摊投资包括社会中介机构审计费用；在财政部的其他相关规定也有这方面规定。
实际操作中，基本服务费率主要根据工程投资总额确定（这部分金额主要满足中介机构的交通、食宿、单位收益等基本费用）。
看完本文的内容介绍之后，对于这个问题的处理大家都清楚了吧。
在实际中，我们需要知道怎么来进行解决这样的问题，才能完成相关的合同金额支付的事情，这是支付方要重视的情况，才能知道怎么办。
法律依据：《建设工程价款结算暂行办法》第十条 工程设计变更价款调整(一)施工中发生工程变更，承包人按照经发包人认可的变更设计文件，进行变更施工，其中，政府投资项目重大变更，需按基本建设程序报批后方可施工。
(二)在工程设计变更确定后14天内，设计变更涉及工程价款调整的，由承包人向发包人提出，经发包人审核同意后调整合同价款。
变更合同价款按下列方法进行：1、合同中已有适用于变更工程的价格，按合同已有的价格变更合同价款；2、合同中只有类似于变更工程的价格，可以参照类似价格变更合同价款；3、合同中没有适用或类似于变更工程的价格，由承包人或发包人提出适当的变更价格，经对方确认后执。
如双方不能达成一致的，双方可提请工程所在地工程造价管理机构进行咨询或按合同约定的争议或纠纷解决程序办理。