季度弥补亏损后需要进行汇算清缴。具体处理方法有以下几步：
核算季度利润：根据季度的财务报表计算出利润或亏损金额。
利用季度亏损抵扣税款：如果季度出现亏损，可以利用亏损抵扣应纳税款。按照《税收法》的规定，可以抵扣以前年度的留抵税额或者以后年度的应纳税额。
申请汇算清缴：在年度结束后，需要将当年的所有纳税情况进行统计和核对，并在规定的时间内提交申请汇算清缴的申报表。
计算应纳税款和退税款：进行汇算清缴后，需要计算出应纳税款和退税款的金额，并在规定的时间内将税款缴纳或申请退税。
填写完税表和缴纳税款：根据计算的应纳税款或退税款金额填写完税表，并按照规定的时间将税款缴纳或领取退税。
以上是季度弥补亏损后汇算清缴的处理流程。需要注意的是，在处理过程中需要严格遵守相关税收法规，并及时向税务部门缴纳税款或进行退税申请。