准备材料：需要提供企业的工商营业执照原件、组织机构代码证原件和税务登记证原件，以及申请表和身份证明等材料。
在工商行政管理部门办理注销手续：企业需要在原发证机关(即工商行政管理部门)办理注销手续，并领取注销证明。
在其他相关部门办理变更手续：企业需要在税务局、统计局等部门办理变更手续，领取新的组织机构代码证和税务登记证。
在工商行政管理部门办理换证手续：企业持有注销证明和其他相关材料，到工商管理部门办理换证手续，领取新的营业执照。
需要注意的是，不同地区的具体情况可能会有所不同，建议企业在办理前先咨询当地相关部门的规定。此外，根据相关规定，营业执照三证合一的有效期为5年，到期后需要重新办理。