法律分析：企业税务风险主要包括两方面: 一方面是企业的纳税行为不符合税收法律法规的规定,应纳税而未纳税、少纳税,从而面临补税、罚款、加收滞纳金、刑罚处罚以及声誉损害等风险。 另一方面是企业经营行为适用税法不准确,没有用足有关优惠政策,多缴纳了税款,承担了不必要税收负担。
法律依据：《中华人民共和国税收征收管理暂行条例》
凡从事生产、经营，实行独立经济核算，并经工商行政管理部门批准开业的纳税人，应当自领取营业执照之日起三十日内，向当地税务机关申报办理税务登记。其他有纳税义务的单位和个人，除按照税务机关规定不需办理税务登记者外，应当在按照税收法规的规定成为法定纳税人之日起三十日内，向当地税务机关申报办理税务登记。
纳税人申报办理税务登记，应提出申请登记报告和有关批准文件，同时提供有关证件。主管税务机关对前款报告、文件、证件审核后，予以登记，发给税务登记证。税务登记证只限纳税人使用，不得转借或转让。税务登记的内容包括：纳税人名称、地址、所有制形式、隶属关系、经营方式、经营范围以及其它有关事项。
企业的税务风险有哪些企业税务风险主要包括两方面：
一方面是企业的纳税行为不符合税收法律法规的规定，应纳税而未纳税、少纳税，从而面临补税、罚款、加收滞纳金、刑罚处罚以及声誉损害等风险。
另一方面是企业经营行为适用税法不准确，没有用足有关优惠政策，多缴纳了税款，承担了不必要税收负担。
一般认为，企业税务风险是指企业的涉税行为因未能正确有效地遵守税法规定，而导致企业未来利益的可能损失。
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税务风险几乎是所有纳税人都会面临的问题，大企业与中小企业相比，由于经济规模大，业务范围广，重大事项多，社会关注度高等原因，其潜在的税务风险更多，风险爆发的可能性更高，造成的损失更大。
第一，用企业管理代替税务管理。大企业在管理过程中，由于上级公司对下级公司绝对控股或全资持股，在股权、财产、经营等方面，有很大的影响力，不自觉地把具有法人地位的不同公司，当作一个企业看待，在并购重组、资产划转等方面，习惯采用无偿划转等方式。
尽管在企业管理上可以将不同的法人企业作为一个企业对待，但在税务管理上，不同的法人企业，甚至不同的分公司之间，都可能是一个个独立的纳税人，相互之间的经济往来。
应该按照独立企业之间的往来收取价款、支付费用，税法一般不承认无偿划转。企业统一管理和税务区别管理的矛盾，导致许多潜在的风险。
第二，用情理观念代替税法规定。在处理某些具体问题时，很多大企业往往首先从情与理的角度出发，而不是从税法的规定出发。情与法之间，理与法之间，经常发生矛盾，合情合理的做法，不一定合法。
比如，企业自税务机关取得的代扣代缴个人所得税的手续费，虽然实践中可能存在不征的现象，但严格来讲，应该征收营业税和企业所得税。税务机关之所以给企业支付部分费用，是因为企业给税务机关提供代理服务了。
一些纳税人从情理的角度出发，认为税务机关支付的手续费不应征税，税务风险由此产生。涉税问题的处理，首先应该从税法的规定出发，将税法作为判定是否应该纳税的统一尺度，在执法和司法的过程中，法大于情，法大于理。当然，不合情、不合理的规定，也应适当调整。
第三，观念更新落后于征管的进步。税务机关不断从制度建设、技术手段、思想观念等方面强化依法征税，征管的环境已经发生很大变化。随着金税工程的实施，税务机关已经建立一套完整严密的征管系统，新的企业所得税年度纳税申报表，更是要求纳税人将更多的涉税信息提交给税务机关。
同时，税务机关不断完善依法征税的制度建设，税务人员随意执法的现象已经明显减少。与征管环境的变化相比，有的纳税人的观念，还停留在以往的习惯，遇到涉税问题，不是分析原因。
避免再犯，而是通过传统的找人“摆平”的方式，尽管可能暂时平息事态，但以后还是难免再次爆发，导致更大的损失。
参考资料来源：百度百科-税务风险
新时代如何提升税务系统财务风险防控能力新时代提升税务系统财务风险防控能力方法如下：1、强化强化风险意识，加强内部管理。
税务局内部需要建立健全的财务风险管理制度，将预防和控制风险的措施纳入日常工作。
加强对涉税企业的风险评估和监测。
通过数据分析和监测，及时发现和排查涉税企业的风险点，对存在高风险的企业进行重点关注和管理。
整合税务信息资源，提高信息处理能力。
通过信息化手段，实现对涉税企业的全面覆盖、跨部门合作和快速响应，提高信息处理的效率和准确性。
提高税收征管水平，加大税收执法力度。
完善税收政策和法规，加强纳税人守法意识教育，同时对违法企业依法予以处罚和惩戒，推动企业依法纳税和自我约束。
健全风险应对机制，提高应急反应能力。
建立健全的应对机制，对突发事件进行及时应对和处理，并加强应急预案演练，提高应对能力和效率。