建筑工程结算中，甲供材结算的时候按原价扣除，其他费用不扣除。
扣除的原则：应该以计入预算造价时的材料预算价格作为扣除甲供材料的价格标准。
国家标准GB50500—2003《建设工程工程量清单计价规范》中明确规定：甲供材料应计入投标报价中，并在综合单价中体现。
法律依据：《中华人民共和国城市房地产管理法》第十二条土地使用权出让，由市、县人民政府有计划、有步骤地进。
出让的每幅地块、用途、年限和其他条件，由市、县人民政府土地管理部门会同城市规划、建设、房产管理部门共同拟定方案，按照国务院规定，报经有批准权的人民政府批准后，由市、县人民政府土地管理部门实施。
房地产选择甲供材料如何纳税 3%最新政策根据2016年3月23日, 财政部、国税总局颁布的《关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》相关规定,增值税的计税方法有两种,包括一般计税方法和简易计税方法,税率分别是11%和3% , 一般计税方法进项可以抵扣,简易计税方法进项不可以抵扣。
一般纳税人为甲供工程提供的建筑服务 ,可以选择适用简易计税方法计税。
甲供工程,是指全部或部分设备、材料、动力由工程发包方自行采购的建筑工程。
5月1日营改增以后,业主、总包、分包,如果业主是房地产开发公司,业主一定选择一般计税方法,对施工企业来讲选择-般计税还是简易计税,要通过计算来看,所以营改增以后,选择简易计税还是一般计税，业主买多少,施工企业买多少,都需要计算之后再来签合同,否则就会两败俱伤。
所以结论是:若方购买材料,在全部材料中所占得比重决定施工企业选择一般计税方法还是简易计税方法,这个比重是48.18%。
营改增后的遗留工程的甲供材税金处理甲供材的施工单位，选择简易计税法税率为3%不得有进项抵扣。
应按总包合同价款加价外价÷（1+3%）×3%。