这种情况一般处理：先通知购货方作进项税额转出处理。
问题中的这种情况属于将电子发票进行了作废，而纸质发票交给了购货方，并且购货方通过了认证进行了进项税额抵扣。
在增值税稽核系统属于作废发票，那么在次月的19号经过国家税务总局进行比对以后，系统会提示发票为作废发票，抵扣凭证审核系统会通知购货方主管税务机关进行协查，购货方主管税务机关会通知购货方作进项税额转出处理，并将协查结果回复给开票方主管税务机关。
而对于销货方来说，因为发票已经作废，在本月肯定没有进行作销售处理，那么，在这个月可以重新再开正确发票,购货方接到重开发票按照正常程序重新抵扣。
出现这类情况，购货方发票联、抵扣联不得退回给销货方。