一般纳税人企业收到的增值税专用发票发票，需要进行勾选认证后抵扣，其勾选操作流程为
登录增值税发票选择确认平台，点击“发票勾选”
选择“未勾选”的选项和开票日期。点击“查询”。
所选的开票日期区间的所有未认证的发票均显示出来。
勾选所需认证的发票，点击“保存”后进行确定。
在确认勾选界面将刚才的发票查询出来。
点击确认，核对勾选的信息，无误后点提交。
确认结果提交完毕后，本次的勾选认证就成功了。
增值税进项发票抵扣的操作流程有哪些登陆进入“增值税发票综合服务平台”，点击“抵扣勾选”—“发票抵扣勾选”；
查询当期可勾选的发票信息，确认当期需要抵扣勾选的发票，将当期需要抵扣的发票勾选，并点击“提交”；
确认当期需要抵扣的发票信息，确认无误后点击“确认”，可通过“已勾选”再次查询、确认当期抵扣的发票，确认无误后，点击“抵扣勾选”-“抵扣勾选统计”；
点击“申请统计”按钮；点击“确定”按钮。
再次对本月抵扣统计表进行复核，复核结果无误的，点击“确认”按钮，即可在申报时抵扣进项税款；复核结果有误的，选择“撤销统计”后，可重新进行勾选确认。
增值税发票如何进行抵扣法律分析：先认证、再申报抵扣，这样操作了才叫抵扣。
增值税一般纳税人，按销售计算销售税额，按进项计算进项税额，差额才需要交税。
销项税额很好计算，你的含税销售额，包含不含税销售额和税额，不管是你否开具增值税专用发票，都需要计算的。
而进项税额，即有一些限制，主要是三点：1、是一般纳税人(小规模纳税人不允许抵扣，也就不存在进项税额)2、采购进项对应的货物或劳务，是用于应税项目的3、取得抵扣凭证(即增值税专用发票或其他允许抵扣发票的抵扣联，没有抵扣联是不能抵扣的)。
当取得抵扣凭证并符合抵扣条件时，需要先认证，所谓认证，就是将进项发票与税局服务器比对，相符时就认证通过(允许抵扣)，然后在次月申报时，需要在增值税纳税申报表上申报你一个期间认证通过的进项税额，并从销项税额中抵减，抵减后的差额做为当期应纳增值税额进行申报。
增值税是以商品生产流通环节或提供劳务的增值额为计税依据而征收的一种税。
一般纳税人销售或进口货物税率有17%和13%，提供加工、修理修配劳务税率17%。
增值税应纳税额期销项税额-当期进项税额。
法律依据：《中华人民共和国增值税暂行条例》 第三条 纳税人兼营不同税率的项目，应当分别核算不同税率项目的销售额；未分别核算销售额的，从高适用税率。
除本条例第十一条规定外，纳税人销售货物、劳务、服务、无形资产、不动产（以下统称应税销售行为），应纳税额为当期销项税额抵扣当期进项税额后的余额。
应纳税额计算公式：应纳税额期销项税额－当期进项税额当期销项税额小于当期进项税额不足抵扣时，其不足部分可以结转下期继续抵扣。