税务违章处理程序指税务机关处理税务违章案件的工作步骤。税务机关处理违章案件应本着“实事求是”的原则，做到事实清楚，证据确实，定性准确，处理恰当，宽严适度，依法办事。其处理程序一般包括立案、调查、处理三个步骤。 [1]
立案，即税务机关对违章行为比较严重，偷逃税数额较大，涉及面较广或者情节恶劣，影响较大的案件，建立专门的案卷，并组织专门人员调查处理。调查，即税务机关对立案的案件，由专门人员向有关企业单位和个人进行广泛的内查、外调，取得证据，核实材料，查清事实。处理，即税务机关对调查核实的案件，按照法律规定作出处理。对事实清楚，已达到刑法规定的偷、抗税罪标准的案件，应将案卷移送检察机关，由检察机关追究刑事责任; 对事实清楚，但未达到刑法规定的偷、抗税罪标准的案件，税务机关应按《中华人民共和国税收征收管理暂行条例》的有关规定，作出处理决定，并填写《税务违章处理通知书》通知违章者执行。对超过税务机关规定期限未缴纳税款、滞纳金、罚款的违章者，税务机关应填写《催缴税款通知书》 ，通知其限期执行。违章者对税务机关的违章处理不服时，应先缴清税款、滞纳金、罚款，然后可在规定的期限内向上一级税务机关申请复议
税务稽查的流程和步骤步骤与流程：主要分为选案、检查、审理、执行四个环节。
选案，即是对各类涉税数据、信息和线索进行收集、处理、立案、反馈，检查，即是收集案件的证据材料，对涉税疑点进行查证。
审理，即是核实案件事实、审查鉴别证据、依法认定违法行为性质，制作结论性文书。
执。
即是将税务文书送达被执行人。
督促其按规定缴纳税收款项,对不主动履行的被执行人依法采取税收保全、强制执行措施。
选案环节由税务稽查局选案科筛选要进行税务稽查的对象，选择方式包括人工选案、计算机选案、举报、其他等等。
选择完毕后，经稽查局局长批准，再将拟计划税务稽查的企业名单送至检查科进行检查。
检查环节检查科再根据选案科的企业名单，组织稽查人员实施税务稽查，通过采取必要的稽查方法的手段，收集案件的证人证言、书面证据，整理制作了《税务稽查报告》后，将案件移送至税务稽查局审理科。
检查前，税务稽查应当告知企业检查时间、需要准备的资料等，检查应当由两名以上具有执法资格的检查人员共同实施，并向被查对象出示税务检查证件、出示或者送达税务检查通知书。
采取调取账簿资料、实地检查、询问、查询存款账户、异地协查等方式，对企业的财务资料进行税务稽查，寻找企业少交税款、晚交税款的线索，但对于多缴税款不属于其税务检查的范围。
审理环节税务稽查检查结束后，审理科对案件进行审理，对于检查人员的初步意见作出最终决定，形成结论性文书。
对于涉案金额较大的，则应当提请税务局重大税务案件审理委员会进行审理。
执行环节税收执行部门根据税务处理决定书送达至当事人，要求当事人进行补缴税款，待执行完毕税款入库后形成执行报告，并将缴款凭证复印件等资料交给案卷管理科室，进行入库保管。
税务稽查的范围：包括税务法律、法规、制度等的贯彻执行情况，纳税人生产经营活动及税务活动的合法性，偷、逃、抗、骗、漏税及滞纳情况。
法律依据：《税务稽查工作规程》 第十五条 稽查局必须有计划地实施稽查，严格控制对纳税人、扣缴义务人的税务检查次数。
稽查局应当在年度终了前制订下一年度的稽查工作计划，经所属税务局领导批准后实施，并报上一级稽查局备案。
年度稽查工作计划中的税收专项检查内容，应当根据上级税务机关税收专项检查安排，结合工作实际确定。
经所属税务局领导批准，年度稽查工作计划可以适当调整。