国税零申报的具体操作流程如下：
登录国税网上纳税申报系统，输入纳税人识别号和密码。
进入纳税主界面，点击报税。
先填写纳税人信息采集表。
在进行增值税小规模纳税人申报时，需要先删除两个报表的关联性：应税服务扣除项目清单和增值税纳税申报表附列资料。注意：点击右键删除之后，报表还是存在的。但无需介意，点击删除后两个报表即取消了关联性。
按顺序填写税额抵减情况表、申报表主表辅助填报工具和增值税纳税申报表，把税额填写为零。
填写营改增试点企业税负变化表，直接补零保存即可。
最后填写代征地税申报表。所谓零申报是指企业当期没有任何销售收入，或者大量抵扣进项，导致申报纳税时销售收入或应纳税额为零。只要企业的销售和收入情况属实，就可办理零申报。但是如果企业零申报次数太多，税务局就会对企业的财务状况进行检查，所以进行零申报时企业必须确定收入为零或大量进项是真实的。国税申报主要分为四个部分：代征地税；纳税人信息采集表；增值税小规模纳税人申报表；企业税负变化表。其中代征地税需要用到上诉其他报表的数据，因此最后进行申报。