增值税一般纳税人丢失已开具的增值税专用发票或货物运输业增值税专用发票发票联和抵扣联的，由销售方到主管税务机关提出申请开具《丢失增值税专用发票已报税证明单》或《丢失货物运输业增值税专用发票已报税证明单》，销售方主管税务机关核对后开具。办理流程：
报送资料：已丢失增值税专用发票、货物运输业增值税专用发票的记账联复印件。
办税服务厅接收资料，核对资料是否齐全、是否符合法定形式，通过系统核对纳税人丢失发票是否报税，丢失发票已报税的即时办结；不符合的当场一次性提示应补正资料或不予受理原因。
现场开具并发放《丢失增值税专用发票已报税证明单》或《丢失货物运输业增值税专用发票已报税证明单》。
《国家税务总局关于简化增值税发票领用和使用程序有关问题的公告》（2014年第19号）
简化丢失专用发票的处理流程
一般纳税人丢失已开具专用发票的发票联和抵扣联，如果丢失前已认证相符的，购买方可凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件及销售方主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》或《丢失货物运输业增值税专用发票已报税证明单》（附件1、2，以下统称《证明单》），作为增值税进项税额的抵扣凭证；如果丢失前未认证的，购买方凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件进行认证，认证相符的可凭专用发票记账联复印件及销售方主管税务机关出具的《证明单》，作为增值税进项税额的抵扣凭证。专用发票记账联复印件和《证明单》留存备查。
一般纳税人丢失已开具专用发票的抵扣联，如果丢失前已认证相符的，可使用专用发票发票联复印件留存备查；如果丢失前未认证的，可使用专用发票发票联认证，专用发票发票联复印件留存备查。
一般纳税人丢失已开具专用发票的发票联，可将专用发票抵扣联作为记账凭证，专用发票抵扣联复印件留存备查。
房屋增值税发票丢失怎么补办法律分析：增值税发票丢失的补办办法：1.把存根联复印，2交客户当地主管税务局确认并出具未抵扣税证明，3.报本公司主管税务局，开具红字发票冲原开发票，4.再重新填开发票给客户。购票单位应于事发当日书面报告国税机关，报告内容包括专用发票份数、字轨号码、盖章与否等情况。发票丢失可分为以下几种情况：一、发票未开出即丢失；二、发票开出未认证时丢失；三、发票开出并认证时丢失。
法律依据：《中华人民共和国发票管理办法实施细则》第三十一条 使用发票的单位和个人应当妥善保管发票。发生发票丢失情形时，应当于发现丢失当日书面报告税务机关。
如何开具丢失增值税专用发票已报税证明单?申请开具《丢失增值税专用发票已报税证明单》流程：
首先去税务服务厅申请。纳税人携带上述资料到办税服务厅申报征收岗申请开具丢失增值税专用发票已抄报税证明单。
受理审核。办税服务厅申报征收岗受理审核纳税人提交的资料。符合条件的，当场受理办理。纳税人提交纸质资料不全或者填写内容不符合规定的，一次性告知纳税人补正或重新填报。
纳税人提供资料符合条件的，办税服务厅申报征收岗即时开具丢失增值税专用发票已抄报税证明单。
扩展资料：
增值税专用发票已经填开但丢失的处理方法
一般纳税人丢失防伪税控系统开具的增值税专用发票，如果该发票丢失前已通过防伪税控认证系统的认证，购货单位可凭销货单位出具的丢失发票的存根联复印件及销货方所在地主管税务机关出具的“增值税一般纳税人丢失防伪税控开具增值税专用发票已抄报税证明单”；
经购货单位主管税务机关审核批准后，作为增值税进项税额抵扣的合法凭证抵扣进项税额。
一般纳税人丢失防伪税控系统开具的增值税专用发票，如果该发票丢失前未通过防伪税控认证系统的认证，购货单位应凭销货单位出具的丢失发票的存根联复印件到主管税务机关进行认证；
认证通过后可凭该发票复印件及销货方所在地主管税务机关出具的“增值税一般纳税人丢失防伪税控开具增值税专用发票已抄报税证明单”，经购货单位主管税务机关审核批准后，作为增值税进项税额抵扣的合法凭证抵扣进项税额。
一般纳税人发生丢失防伪税控系统开具的增值税专用发票情况，必须及时向所在地主管税务机关报告，税务机关应对其报告的丢失发票是否已申报抵扣进行检查，对纳税人弄虚作假的行为，按照有关的法律法规进行处理。
参考资料来源：央视网-一般纳税人丢失增值税专用发票如何处理