新疆电子税务局网上申报流程是：1、首先打开新疆电子税务局网。
进入我要办税模块后,选择想要申报的项目。
之后将申报的所有信息输入进去即可。
以上就是新疆电子税务局网上申报流程。
新疆维吾尔自治区小规模营改增国税怎样申报【办理时限】
（一）纳税人办理时限
纳税人以1个月或者1个季度为1个纳税期的，自期满之日起15日内申报纳税；
以1日、3日、5日、10日或者15日为1个纳税期的，自期满之日起5日内预缴税款，于次月1日起15日内申报纳税并结清上月应纳税款；
纳税人进口货物，应当自海关填发海关进口增值税专用缴款书之日起15日内缴纳税款；
遇最后一日是法定休假日的，以休假日期满的次日为期限的最后一日；在期限内有连续3日以上法定休假日的，按休假日天数顺延；
不能按照固定期限纳税的，可以按次纳税。
（二）税务机关办理时限
报送资料齐全、符合法定形式、填写内容完整，受理后即时办结。
【报送资料】
以下资料中，纳税申报表及其附列资料为必报资料。纳税申报其他资料的报备要求由各省、自治区、直辖市和计划单列市国家税务局确定。
（一）纳税申报表及附列资料
（1）《增值税纳税申报表（小规模纳税人适用）》及附表各3份。
（二）纳税申报其他资料
（2）使用税控收款机的纳税人应报送税控收款机用户卡等存储开票信息的存储介质，也可点对点或网络传输开票信息。
（3）已开具的税控“机动车销售统一发票”和普通发票的存根联。
（4）跨境应税服务免征增值税应报送《跨境应税服务免税备案表》,同时报送以下资料：
——跨境服务合同原件及复印件；
矿产资源在境外的工程勘察勘探服务、会议展览地点在境外的会议展览服务、存储地点在境外的仓储服务、标的物在境外使用的有形动产租赁服务、在境外提供的广播影视节目（作品）发行、播映服务、广告投放地在境外的广告服务，以上服务提交服务地点在境外的证明材料原件及复印件；
——跨境服务中国际或者港澳台运输服务，应提交实际发生相关业务的证明材料；
——向境外单位提供跨境服务，应提交服务接受方机构所在地在境外的证明材料；
自治区、直辖市和计划单列市国家税务局要求的其他资料
（5）《增值税减免税申报明细表》，由享受增值税减免税优惠政策的小规模纳税人在办理增值税纳税申报时填报。仅享受月销售额不超过3万元（按季纳税9万元）免征增值税政策或未达起征点的增值税小规模纳税人不需填报明细表，即小规模纳税人档期增值税纳税申报表主表第9栏“其他免税销售额”“本期数”和第13栏“本期应纳税额减征额”“本期数”均无数据时，不需填报明细表。
（6）省税务机关规定的其他资料。
【基本流程】
新疆税务网上申报流程法律分析：纳税人根据业务办理范围，以纳税人15位编码注册，并按申请表中栏目填写必要信息，完整、准确填写“申请理由”事项，并点击“提交”。 税务机关通过各地、州、市局核实纳税人所提交业务内容事实是否属实。 对不属实或不属于自治区区级地税局办理范围的业务，将通过纳税人所填电话或电子邮件的方式告知原因，如属于我局下级地税机关处理范围并通知相应下级地方税务局。 审核通过的纳税人，将出现“审核成功！”提示信息，此表单内容信息将进入我局正常业务工作处理流程。 纳税人以15位纳税人编码及密码进入网上办系统。“点击”左栏相应的业务处理模块，申请并按表中所列栏目，填写信息，准确无误后，提交信息， 对已进入我局正常业务处理范围的业务工作，我局将依照有关的法律规定的时间、程序，将处理结果在网上公布，纳税人凭借密码查询各自处理结果。
法律依据：《中华人民共和国税收征收管理法实施细则》 第四条 国家税务总局负责制定全国税务系统信息化建设的总体规划、技术标准、技术方案与实施办法；各级税务机关应当按照国家税务总局的总体规划、技术标准、技术方案与实施办法，做好本地区税务系统信息化建设的具体工作。地方各级人民政府应当积极支持税务系统信息化建设，并组织有关部门实现相关信息的共享。