当前，很多公司经营不下去会选择进行公司注销。而就公司注销来讲，公司在注销前会经过一系列的审核。这就导致许多老板产生这样一个认识误区：认为公司只要注销了，即便后面被发现税务相关问题也与自己无关了。事实上，这一观点是错误的。
因此，公司要想不被查，先得会自查，在办理公司注销前，这些容易“爆雷”的坑一定要妥善处理。具体包括以下情形：
账面有存货，但无实物
已经销售的货物不做账、不开发票，隐瞒销售收入，同时销售成本不结转，导致账面存货数大于实际库存数。
处理办法：需立即进行自查，并补缴增值税、企业所得税等税款。
存货损毁需查明原因，如果有充分证据证明属于合理损耗，那么增值税无需处理，损失也可以在企业所得税前扣除。
账面有存货，但已过期
该情况有两种处理方式：
作为资产损失处理；
低价销售。
增值税有留抵不能退，开票给关联方了
在此需要提醒注意的是：与关联公司之间的交易必须有合理的商业目的，且价格公允，否则，可能会被认定为虚开发票！
老板从公司借款未归还
企业注销前一定要好好自查一下“其他应收款”等往来科目。
印花税未足额缴纳
印花税的征税范围非常广泛，购销、租赁、注资、营业账簿等都涉及印花税。
而这平时不起眼的小税种在注销的时候通常会被税务局翻个底朝天。
此外，如今随着金税四期到来，预警系统会更为严密，公司正常经营期间一定要：如实申报、四流合一。否则，一旦税务存在问题，即便是公司注销了，也会依法追究公司责任。
公司注销常见税务问题1、非正常户如何注销？
被纳入了非正常户的企业，还需要先补充纳税申报、补缴税款并缴纳相应的滞纳金和罚款，解除非正常状态后，才能按照正常程序提交注销申请。
注销时税务要查三年的账吗？
目前税收法规并没有明确规定公司注销时必须查账，要视企业的具体情况而定。之所以有查三年账的说法，是因为《税收征管法》第五十二条对税款追缴期有规定：“因税务机关的责任，致使纳税人、扣缴义务人未缴或者少缴税款的，税务机关在三年内可以要求纳税人、扣缴义务人补缴税款，但是不得加收滞纳金。”再次提醒大家：不要以为注销完就没事了，如果有偷税漏税等违法行为，税务机关可以无限期追责。
公司注销与吊销有何区别?
该怎么处理非正常注销?
一般纳税人企业如何进行注销?企业注销流程是怎样的?
公司注销后有税务问题如何处理法律主观：公司经营就离不来经济往来相关活动，因此免不了就会涉及到一些税务上问题。但一般收税纳税都是公司发展中一笔不小的经济压力，但不可避免就算是公司要注销，也是需要办理好税务上的问题。一、公司注销要处理那些税务问题1、印花税在企业注销的时候，却显得非常重要，该补的要赶紧补齐。因为有关企业的重大合同，均会进行印花税审核。实收资本、资本公积、营业账簿、租赁、购销合同都要检查。2、账面存货要交税账面存货一般会出现在商贸批发行业中的企业。比如说，某商贸批发企业，不想继续经营了，准备进行注销，账面上还有存货，则会分配给股东或者投资者，作为出资的收回或者利润的分配。3、账面库存大于实物库存往往注销企业出现账面库存大于实物库存的原因，是因为商品销售后漏报了收入而导致的。可能出现在公司注销时，账面上有库存，但实际上仓库里面什么都没有了的情况。而出现这种状况，税务实地核查后，轻则按视同销售来处理，重则需要补交滞纳金。4、库存坏了针对食品销售公司，在注销时，例如，仓库中有150万元（含税）的食品因管理不善而导致过期，发票已经认证抵扣了。虽然账面上这150万元确实不值钱，但是根据增值税管理办法，因管理不善造成的损失，之前做了进项抵扣的必须进项转出。二、公司注销税务处理方式1、公司注销如果是地税共管户，那么一般纳税人首先就应该办理国税注销登记，注销登记办理好了之后自取处理地税注销登记。2、登记地税和国税纳税人还需要填写《注销税务登记申请表》，并到主管区局申请清缴发票和清缴税款。3、纳税人办理清缴发票和清缴税款之后，持《注销税务登记表》前往主管区局或者是主管税务办事处的综合服务窗口办理注销。4、税务人员录入注销税务登记受理信息，并向纳税人发放受理回执。同时主管税务机关需要对纳税人实施注销税务稽查(核准)。5、纳税人凭主管税务机关实施注销税务稽查(核准)后加盖同意注销意见的《注销税务登记申请表》、原注销受理回执及税务登记证到主管区局或主管税务所的综合服务窗口办理注销核准手续。6、税务人员的受理纳税人的注销核准申请后，收回纳税人的税务登记证件正、副本并为纳税人开具《注销税务登记通知书》。三、注销税务登记的期限1、纳税人发生解散、破产、撤销以及其他情形，依法终止纳税义务的，应当在向工商行政管理机关或者其他机关办理注销登记前，持有关证件向原税务登记机关申报办理注销税务登记；按照规定不需要在工商行政管理机关或者其他机关办理注册登记的，应当自有关机关批准或者宣告终止之日起15日内，持有关证件向原税务登记机关申报办理注销税务登记。2、纳税人因住所、经营地点变动而涉及改变税务登记机关的，应当在向工商行政管理机关或者其他机关申请办理变更或注销登记前或者住所、经营地点变动前，向原税务登记机关申报办理注销税务登记，并在30日内向迁达地税务机关申报办理税务登记。3、纳税人被工商行政管理机关吊销营业执照或者被其他机关予以撤销登记的，应当自营业执照被吊销或者被撤销登记之日起15日内，向原税务登记机关申报办理注销税务登记。
法律客观：《中华人民共和国市场主体登记管理条例实施细则》第四十六条申请办理注销登记，应当提交下列材料：（一）申请书；（二）依法作出解散、注销的决议或者决定，或者被行政机关吊销营业执照、责令关闭、撤销的文件；（三）清算报告、负责清理债权债务的文件或者清理债务完结的证明；（四）税务部门出具的清税证明。除前款规定外，人民法院指定清算人、破产管理人进行清算的，应当提交人民法院指定证明；合伙企业分支机构申请注销登记，还应当提交全体合伙人签署的注销分支机构决定书。个体工商户申请注销登记的，无需提交第二项、第三项材料；因合并、分立而申请市场主体注销登记的，无需提交第三项材料。
公司注销时需要注意哪些税务问题?公司会由于各种原因可能经营不下去而倒闭，公司倒闭有两种方法，一种是转让公司，另一种就是注销公司，如果选择注销那就需要把税务方面的问题解决了，比如要去清税，没有交的税需要补交，欠下的税款也需要。如果没有及时或拒不缴纳欠税的话，将收到法律的制裁，因此，公司若是要注销的话一定要记得清税。
公司注销税务期间，主要有以下涉税事项：
流转税
清算期间，企业往往会有存货、固定资产等交易行为，包括直接销售或转让、资产分配两种。对于资产的直接销售和转让行为，企业在清算期间要将其视为正常的货物销售行为，要按照和所得税的纳税要求来及时缴纳税金，对于企业的不动产，纳税应该由购买方承担，该项税额可以进行适当的转移。资产分配，即注销企业资产直接分配个股东或投资者，纳税人资产进行分配的，都应当按照视同销售进行税务处理。
所得税
所得税是企业开展日常经营管理工作时必须要缴纳的税种之一，是企业在清算期间结束经营业务之后，对企业自身的剩余财产和债务分配进行清算，并对自己的经济行为进行所得清算、分配企业的股息;根据，企业清算期间所得税处理主要包括：可向股东分配的剩余财产、应付股息;确认债权、清偿债务所得或损失;处理预提、待摊费用;弥补亏损，确认清算所得;全部资产按变现价值或价格，确认资产转让所得及损失等。其中，清算所得的计算为资产处置损益减去清算费用、税金及附加、债务清偿损益、往期亏损及其他所得或支出，即为清算所得。
其他税类
其他税类主要包括清算中房屋租赁税、印花税、各种欠税和罚款等。这类税种对企业的经营发展具有重要的作用，企业在清算期间要重视其他类税种对企业清算工作的影响。
房屋租赁税
一般来说，房屋租赁税是公司注册地址的房东向接到每月缴纳的，因此在注销公司的时候要跟房东确定其是否有按时缴纳房屋租赁税，如果没有的话，就需要到地税补交(从租赁起到终止)按照租金的12%缴纳。
印花税
根据规定公司注销了，需要检查公司实际缴纳出资，印花税需要按照实际出资金额进行缴纳，如果没有实际缴纳注册资本的话就不要缴纳印花税。
各种欠税和罚款
欠税和罚款没有缴清的话是不能直接注销的。根据《公司法》的，公司注销清算组应主动对企业申报的欠税情况进行全面清查，核实欠税是否属实，对企业欠税在清偿过程中优先清偿，避免税收流失。《企业所得税法》，企业在年度中间终止经营的，应自实际经营终止之日起60日内向税务机关办理当期企业所得税汇算清缴。企业在注销前，清算所得并向税务机关申报缴纳企业所得税。
公司注销光是税务注销这一项就够大家忙一段时间了，税务注销属于公司注销整个流程里面比较麻烦的了，很多企业办理注销难就难在了税务注销上面，公司越大规模越大成立时间越长可能税务注销就越难。