总的来说，根据中华人民共和国外商企业收入税法和地方营业税法的规定，外商代表机构将缴纳外商独资企业收入税及营业税，但缴纳形式有所不同。
最常见的基础是附加成本基础。
如2002年4月，这种评估方式下的税务负担约为外商代表机构经营支出的10%。企业收入税及营业税，在每个季度结束前15天向外商代表机构征收。
根据中国相关税法，如果满足一定条件，外商代表机构可以向有关部门申请免税要求。
因中国法律的规定，外资代表处是不能经营业务的，因而不能开具发票，无需交纳流转税，因而也不需要交纳地方教育附加税、城建税、河道管理费等地方附加税种。
依据中国关于外国地区企业常驻代表机构相关税收政策的规定，外资代表处注册完成后，只需按成本费用支出交纳营业税与所得税，此外还需缴纳个人所得税，代表处无需交纳教育附加税等附加税种。
虽然代表处不能经营实际业务，但每个月必须做帐与报税，一般可委托代理记帐公司办理，可以节省费用支出。