已经作废的增值税发票必须敲盖"作废"章或"作废"字样，可单独存放，发票必须全部联次妥善保管，粘贴在原发票存根上，不得私自销毁，以备查核。
《中华人民共和国税收征收管理法实施细则》二十九条：
第二十九条 账簿、记账凭证、报表、完税凭证、发票、出口凭证以及其他有关涉税资料应当合法、真实、完整。
记账凭证、报表、完税凭证、发票、出口凭证以及其他有关涉税资料应当保存10年；但是，法律、行政法规另有规定的除外。
《会计档案管理办法》规定:会计凭证类的最低保存期限为15年。
对由于开票人员工作失误或其他原因开错的发票，应当在发票上加盖"作废"戳记。重新开具发票，不得在开错的发票上涂改。开错的"作废"发票必须全部联次妥善保管，粘贴在原发票存根上，不得私自销毁，以备查核。