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企业内部控制中的税务风险管理制度从属于企业的内部控制系统，因此其制度设计原则与内部控制系统的设计原则思路基本一致，遵循五大原则。
合法原则。企业内部控制中的税务风险管理，首先要基于法律文件、行业内的准则规范以及监管部门的监管要求，确保其合法性。若企业的制度设计违背了法律规定，那么内部控制的运行将会失效，从而造成企业的不良发展，使其陷入困境。其次，税务风险管理需要贯穿于企业的各个层次和过程当中。从层次方面来看，企业中的每一员工都需要受到内部控制的制约，无论是领导层还是基层员工都必须遵守企业的税务风险内部控制制度。从过程方面来说，企业应当对其管理过程中的所有环节都加以控制，包括计划、决定、执行、监督和反馈等，保证控制过程的有效性，尽可能地降低企业税务风险。
企业内部控制中的税务风险管理制度要求企业在业务流程、权限分配、机构设置和治理结构等方面形成相互牵制、相互监督的关系，同时企业还需要兼顾运营效率。企业内部控制中的监督检查部门持续保持良好的独立性是保证企业内部控制中税务风险管理监督检查公平和公正的前提。企业中各个层级的职员都不得拥有凌驾于内部控制之上的特殊权利。制衡原则具体包括授权和牵制原则。
牵制原则是指在设计企业内部控制中的税务风险管理体系时，任一事项的完成都必须由相互制约的两个或两个以上的部门来完成。授权原则要求企业在基于税务风险管理的基础上，结合企业的具体操作规章手续，根据岗位的不同需求，赋予每个职工不同的工作任务和职责权限。
协调配合原则。企业内部控制中的税务风险管理，需要运用协调配合原则。为了避免扯皮和脱节现象的发生，税务风险控制活动必须与企业各部门密切配合，通过各方面协调同步的工作，从而降低企业内耗，确保企业运行的连续性和有效性。为了使企业税务风险控制工作顺利运行，其基础是协调配合原则。信息交流和沟通的流畅性为协调配合提供了技术支持，倘若税务风险管理人员与相关人员之间沟通不顺畅，那么控制活动即使设计了再清晰的目标和措施也无济于事——因为信息不畅会直接影响责任人不能与相关部门沟通达成一致，从而导致实施效果不理想。因此，在保证信息交流与沟通流畅的前提下，税务风险管理部门与相关部门要协调一致，以保证企业税务风险管理的有效性。
成本效益原则。成本效益原则是指企业在实行税务风险管理过程中，要争取低成本高收益的控制效果。企业为了保证在经营过程中收益大于其成本，体现税务风险管理的价值，应在税务风险内部控制过程中遵循成本效益原则。若企业实施税务风险控制活动的花费大于其给企业带来的收益，那么该控制活动是不经济的。企业成本应与其产生的经济效益之间保持适当的比例，并且只有在风险控制方案耗费的成本低于其能获得的收入时，该风险控制方案才是合理、可行性的。
重点监控原则。对企业发挥作用大、影响范围广的关键点进行控制，即为企业的重点监控原则。企业在进行税务风险内部控制时应对其投入大量精力，影响范围广的重要点进行把握，对影响程度有限的一般控制点无须花费过多的时间精力去控制。通过分析企业涉税过程中的关键税种，对其进行识别和评估，从而发现会产生重大影响的税务风险，通过及时采取应对控制措施，对其进行重点监控。
企业的税务风险有哪些企业税务风险主要包括两方面：
一方面是企业的纳税行为不符合税收法律法规的规定，应纳税而未纳税、少纳税，从而面临补税、罚款、加收滞纳金、刑罚处罚以及声誉损害等风险。
另一方面是企业经营行为适用税法不准确，没有用足有关优惠政策，多缴纳了税款，承担了不必要税收负担。
一般认为，企业税务风险是指企业的涉税行为因未能正确有效地遵守税法规定，而导致企业未来利益的可能损失。
扩展资料
税务风险几乎是所有纳税人都会面临的问题，大企业与中小企业相比，由于经济规模大，业务范围广，重大事项多，社会关注度高等原因，其潜在的税务风险更多，风险爆发的可能性更高，造成的损失更大。
第一，用企业管理代替税务管理。大企业在管理过程中，由于上级公司对下级公司绝对控股或全资持股，在股权、财产、经营等方面，有很大的影响力，不自觉地把具有法人地位的不同公司，当作一个企业看待，在并购重组、资产划转等方面，习惯采用无偿划转等方式。
尽管在企业管理上可以将不同的法人企业作为一个企业对待，但在税务管理上，不同的法人企业，甚至不同的分公司之间，都可能是一个个独立的纳税人，相互之间的经济往来。
应该按照独立企业之间的往来收取价款、支付费用，税法一般不承认无偿划转。企业统一管理和税务区别管理的矛盾，导致许多潜在的风险。
第二，用情理观念代替税法规定。在处理某些具体问题时，很多大企业往往首先从情与理的角度出发，而不是从税法的规定出发。情与法之间，理与法之间，经常发生矛盾，合情合理的做法，不一定合法。
比如，企业自税务机关取得的代扣代缴个人所得税的手续费，虽然实践中可能存在不征的现象，但严格来讲，应该征收营业税和企业所得税。税务机关之所以给企业支付部分费用，是因为企业给税务机关提供代理服务了。
一些纳税人从情理的角度出发，认为税务机关支付的手续费不应征税，税务风险由此产生。涉税问题的处理，首先应该从税法的规定出发，将税法作为判定是否应该纳税的统一尺度，在执法和司法的过程中，法大于情，法大于理。当然，不合情、不合理的规定，也应适当调整。
第三，观念更新落后于征管的进步。税务机关不断从制度建设、技术手段、思想观念等方面强化依法征税，征管的环境已经发生很大变化。随着金税工程的实施，税务机关已经建立一套完整严密的征管系统，新的企业所得税年度纳税申报表，更是要求纳税人将更多的涉税信息提交给税务机关。
同时，税务机关不断完善依法征税的制度建设，税务人员随意执法的现象已经明显减少。与征管环境的变化相比，有的纳税人的观念，还停留在以往的习惯，遇到涉税问题，不是分析原因。
避免再犯，而是通过传统的找人“摆平”的方式，尽管可能暂时平息事态，但以后还是难免再次爆发，导致更大的损失。
参考资料来源：百度百科-税务风险
老板必须知道的企业15大税务风险老板必须知道的企业十五大税务风险
内部借款
内部借款是指股东向公司借钱，股东向公司借款有可能涉嫌抽逃注册资本也可能涉嫌“视同分红”（股东借款超过一个纳税年度未归）从而导致需要缴纳个人所得税，这个对企业来说是不小的风险。
账外资金回流
把钱借给企业会被怀疑账外资金回流，比如一个做服装生意的老板卖了1000万元的脱衣服，客户都不需要发票，于是老板把这笔钱入进了自己的个人口袋，后来企业要进货需要钱，于是向老板个人借款，这个时候，税务局会认定为企业做两套帐，有账外资金隐藏收入，这对企业来说是个不小的风险。
商业回扣
商业回扣在企业经营过程中非常常见，一位企业老板他们一年营业额9000万有差不多将近2000万的回扣，但这些回扣多，不可能会有发票的，更不可能代收受人扣缴个人所得税。常见的就是医疗器械或者医药行业。
支出无票
所谓支出无票，就是钱花出去了，但是没有拿到发票。发票对企业来说，有着重大的意义，尤其是在做账方面，基本上，企业或财务都知道，发票是主要的原始依据。事实上，企业很多支出都是凭发票做账，尤其是大型企业，做账比较规范，普遍如此。在税局“以票控税”的监管模式下，发票是每个企业都无法绕过的问题。
账面记录不规范
企业的账本或者会计凭证上写着“代开”，“税点”，“回扣”，“送礼”，“礼品”等字眼，会给企业带来不可预料的风险。
增值税发票虚开
增值税发票虚开一般指虚开增值税发票罪，具有下列行为之一的都属于增值税发票虚开：
（1）没有货物购销或者没有提供或接受应税劳务而为他人、为自己、让他人为自己、介绍他人开具。
（2）有货物购销或者提供或接受应税劳务但为他人、为自己、让他人为自己、介绍他人开具数量或者金额不实。
（3）进行实际经营活动，但他人为自己代开，其余的对不能反映纳税情况的有关内容，作虚假填写。
不合规票据
是指发票的抬头、日期等信息不合规。比如企业在1月份的报销中出现了12月份的发票，这就叫不合规发票。不合规票据还包括金额错误，备注档折扣等等，抬头简称是最常见的不合规定问题。
提前开发票
是指企业的交易还没有发生，成本还没有产生就庭前把发票开了，风险在于容易被税务部门认为虚开发票。
存货账实不符
民营企业存在前着一个非常严重的问题，要么实际存货比帐面多要委实际存货比帐面少。
财政性资金收入不缴税
财政性资金收入，许多企业以为是政府补贴，如果缴税不就又还给政府了吗？所以不缴税，留下罚款、补税、滞纳金的风险。
两套账
很多企业都有两套账，内账和外账，实际上他们两套账处理非常简单粗暴，甚至根本不需要稽查，一看对外报表就能判断在通过两套账进行偷税。
大额不需要支付的应付账款
这很可能是企业买发票时，票买进来了，货款却不用付，只好挂“应付帐款买票越多，金额越来越大，最后在财务帐上留下后遗症无法消除。
公司注销问题
随着金税四期上线，社保入税、工商信息联网、银行流水监管，国家在不断地营造一个公平的税收环境。税务管理不规范的企业，风险越来越大，为了逃避风险，最好的办法不外乎规范企业纳税或注销企业。事实上。注销公司一般要做3-4年的税务稽查审计，企业的问题，能经得住稽查？
收入确认按开票时间确认
很多企业是收款的时候开票、确认收入，但也有企业存在客户要发票、打款时间和正常销售时间不一致的情况。如8月1号把货卖了（货已发送完毕）11月1号客户才给付款。
这种情况下，什么时候开票并纳税呢？纳税义务时间是什么时候？按税法规定，纳税义务时间是8月1号，但是大多数企业都是把11月1号客户付款并给客户开票的时间作为纳税义务时间，这也将导致税务风险。
公司账户套现
出借账户，或者帮客户提取现金。客户向企业购买10万元货款给了一张15万元的支票，让客户帮忙提取5万元的现金（不是要回扣，发票面额还是10万元），容易被认定为价外费用征税。