在同一所属期内，纳税人提交申报后才发现需要补充申报或申报错误需要进行更正的。若未清缴，可通过申报表作废功能作废原有申报，再进行重新申报；若已清缴，纳税人可通过申报错误更正功能进行更正。申报错误更正后，系统会自动根据前后申报信息判断应补退金额：
是应补退金额为正，系统会自动产生应补差额税款，纳税人在缴款期限内通过缴款功能补交税款即可，但如果超过缴款期限，则需要到大厅缴款；
是应补退金额为负，即出现多缴税款情况，则请纳税人到主管税务机关申请办理退抵税流程；
是应补退金额为零，则系统自动进行应征数据调整，纳税人不需补交税款或办理退抵税流程。
申报期内
申报成功尚未缴款的，可以在网上直接作废；
申报失败的，无需作废，直接重新申报即可；
申报成功已经缴款的，无法在网上作废，只能做更正申报；
申报期过后
申报成功的，无论缴款与否，都无法在网上作废，只能做更正申报；
按次申报的KJ类代扣代缴申报表，如果没有缴款，可以在网上作废。