苏州网上申请了灵活就业后，缴费可以按照以下步骤进行：
登录苏州市社会保险网上服务平台（http://www.szsi.gov.cn/）。
点击网页右上角的“登录”按钮，使用已经注册的账户和密码进行登录。
在左侧导航栏中点击“缴费查询”或“在线缴费”，选择需要缴纳的社会保险费用（如养老保险、医保等），并输入相关信息，包括个人身份信息、工作单位信息和缴费金额。
选择合适的缴费方式，例如在线缴费。
填写相关银行卡信息，确认缴费金额无误后进行支付。
支付成功后，可在网站上查询缴费记录和社会保险缴费状态。
需要注意的是，灵活就业者的社会保险费用可能会根据工作时间和工资水平不同而有所不同。建议及时缴纳社会保险费用，以免影响相关社会保险待遇的享受。同时，如果您不确定如何缴纳社会保险费用，建议咨询相关部门或专业人士的意见。