进行税收筹划会遇到风险如下：
税收政策风险。主要是纳税人在筹划时因错误选择税收政策或因税收政策发生变化导致纳税人选择的时机不当所带来的筹划风险。
税务行政执法不规范的风险。主要是税法不完善或税务人员执行税法不当而带来的风险。
税收筹划基础不稳、筹划方案不严谨带来的风险。主要是纳税人在筹划时因对自身情况调研不充分，对税法等法律、法规理解不够，致使纳税筹划失败而带来的风险。
法律依据:
《中华人民共和国税收征收管理法》第一条 为了加强税收征收管理，规范税收征收和缴纳行为，保障国家税收收入，保护纳税人的合法权益，促进经济和社会发展，制定本法。
凡依法由税务机关征收的各种税收的征收管理，均适用本法。第三条 税收的开征、停征以及减税、免税、退税、补税，依照法律的规定执行;法律授权国务院规定的，依照国务院制定的行政法规的规定执行。
单位和个人不得违反法律、行政法规的规定，擅自作出税收开征、停征以及减税、免税、退税、补税和其他同税收法律、行政法规相抵触的决定。 第四条 法律、行政法规规定负有纳税义务的单位和个人为纳税人。
行政法规规定负有代扣代缴、代收代缴税款义务的单位和个人为扣缴义务人。纳税人、扣缴义务人必须依照法律、行政法规的规定缴纳税款、代扣代缴、代收代缴税款。
企业税收筹划面临哪些主要风险及如何防范不依法纳税的风险，即企业日常的纳税核算从表面或局部看是按规定操作了，但是由于对有关税收政策把握不到位，实质上形成偷税，从而遭受税务处罚；
决策者存在认识误区，片面认为纳税筹划是财务人员的事情，与其他部门无关或认为只要与税务局的关系好，有事可以通过疏通摆平等，盲目操作，很容易形成纳税风险。
在系统性纳税筹划过程中对税收政策的整体性把握不够，形成纳税筹划风险。如在企业改制、兼并、分设过程中的纳税筹划涉及多种税收优惠，如果不能系统理解，就很容易出现筹划失败的风险
中小企业税收筹划存在的问题有哪些？概念模糊不清，忽略了其重要性。一般来说企业在开展税收筹划的时候，需要拥有良好的筹划概念认知，这样可以更好的进行筹划工作。需要明白的是：税收筹划不同于偷税、漏税，并且正确的税收筹划不仅可以减轻企业税负压力，同时也能提高企业的实际经济效益。除此之外合理的税收筹划对于提高企业的经营管理水平以及竞争力提高都会有所帮助。
成本较高，中小企业无力承担。众所周知中小型企业的底子相对较薄，难以推进税收筹划工作的进展。另外税收筹划操作的专业性要求极高，需要有专业的团队或者自身税务师来实施，这样可以有效地降低风险，对于中小型企业来说，如果花费资金组建财税团队，这可能有点因小失大。
方案制定缺乏专业性。企业在开展税收筹划的时候，需要制定专业的税收筹划方案，毕竟这样可以确保筹划的可行性，而中小型企业的财务人员专业素质不是很高，同时自身知识水平和经验也有限，所以在制定方案时，难以保证方案的专业和可行性。需要注意的是：税收筹划方案的可行性和专业性得不到保证，那么不仅发挥不出筹划应有的价值之外，还会给企业带来不必要的经济损失，甚至可能回收税务部门的行政处罚。