企业税务风险主要包括两方面：
一方面是企业的纳税行为不符合税收法律法规的规定，应纳税而未纳税、少纳税，从而面临补税、罚款、加收滞纳金、刑罚处罚以及声誉损害等风险。
另一方面是企业经营行为适用税法不准确，没有用足有关优惠政策，多缴纳了税款，承担了不必要税收负担。
一般认为，企业税务风险是指企业的涉税行为因未能正确有效地遵守税法规定，而导致企业未来利益的可能损失。
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税务风险几乎是所有纳税人都会面临的问题，大企业与中小企业相比，由于经济规模大，业务范围广，重大事项多，社会关注度高等原因，其潜在的税务风险更多，风险爆发的可能性更高，造成的损失更大。
第一，用企业管理代替税务管理。大企业在管理过程中，由于上级公司对下级公司绝对控股或全资持股，在股权、财产、经营等方面，有很大的影响力，不自觉地把具有法人地位的不同公司，当作一个企业看待，在并购重组、资产划转等方面，习惯采用无偿划转等方式。
尽管在企业管理上可以将不同的法人企业作为一个企业对待，但在税务管理上，不同的法人企业，甚至不同的分公司之间，都可能是一个个独立的纳税人，相互之间的经济往来。
应该按照独立企业之间的往来收取价款、支付费用，税法一般不承认无偿划转。企业统一管理和税务区别管理的矛盾，导致许多潜在的风险。
第二，用情理观念代替税法规定。在处理某些具体问题时，很多大企业往往首先从情与理的角度出发，而不是从税法的规定出发。情与法之间，理与法之间，经常发生矛盾，合情合理的做法，不一定合法。
比如，企业自税务机关取得的代扣代缴个人所得税的手续费，虽然实践中可能存在不征的现象，但严格来讲，应该征收营业税和企业所得税。税务机关之所以给企业支付部分费用，是因为企业给税务机关提供代理服务了。
一些纳税人从情理的角度出发，认为税务机关支付的手续费不应征税，税务风险由此产生。涉税问题的处理，首先应该从税法的规定出发，将税法作为判定是否应该纳税的统一尺度，在执法和司法的过程中，法大于情，法大于理。当然，不合情、不合理的规定，也应适当调整。
第三，观念更新落后于征管的进步。税务机关不断从制度建设、技术手段、思想观念等方面强化依法征税，征管的环境已经发生很大变化。随着金税工程的实施，税务机关已经建立一套完整严密的征管系统，新的企业所得税年度纳税申报表，更是要求纳税人将更多的涉税信息提交给税务机关。
同时，税务机关不断完善依法征税的制度建设，税务人员随意执法的现象已经明显减少。与征管环境的变化相比，有的纳税人的观念，还停留在以往的习惯，遇到涉税问题，不是分析原因。
避免再犯，而是通过传统的找人“摆平”的方式，尽管可能暂时平息事态，但以后还是难免再次爆发，导致更大的损失。
参考资料来源：百度百科-税务风险
企业常见的涉税风险点有哪些？在经营企业的过程中，能够了解常见的涉税风险，进行规避不失为一种妥当的方法。那么常见的涉税风险有哪些呢?这里总结了以下7点：
差旅费中的餐费无论是否取得增值税专用发票，均不得抵扣进项税额
相关依据：财税(2016)36号文件：购进的旅客运输服务、贷款服务、餐饮服务、居民日常服务和娱乐服务产生的进项税额不得从销项税额中抵扣。特别提醒：因餐费不能抵扣进项税额，所以除差旅费以外的职工教育经费、会议费、董事会会费及其他相关成本中的餐费，均需要单独核算或单独列示。
企业注销后账簿等涉税资料的保存应特别注意的事项
政策一：《中华人民共和国税收征收管理法实施细则》(国务院令第362号)第二十九条规定：“账簿、记账凭证、报表、完税凭证、发票、出口凭证以及其他有关涉税资料应当合法、真实、完整。账簿、记账凭证、报表、完税凭证、发票、出口凭证以及其他有关涉税资料应当保存10年;但是，法律、行政法规另有规定的除外。” 因此，账簿等涉税资料应当保存10年，不得擅自销毁。
员工多处取得工资薪金，多处扣除费用标准，少代扣代缴个人所得税。
根据个人所得税相关规定，为了有利于征管，对雇佣单位和派遣单位分别支付工资、薪金的，采取由支付者中的一方减除费用的方法，即只由雇佣单位在支付工资、薪金时，按税法规定减除费用，计算扣缴个人所得税;派遣单位支付的工资、薪金不再减除费用，以支付全额直接确定适用税率，计算扣缴个人所得税。
不能准确把握进项税的抵扣范围，被加处罚款和滞纳金
税法对进项税额抵扣的范围和条件都做了明确的规定，用于非增值税应税项目、免征增值税项目、集体福利和个人消费、非正常损失的货物(劳务)、非正常损失的在产品、产成品所耗用的购进货物(劳务)要按规定作进项税额转出，纳税人要准确把握增值税进项税额的抵扣范围和条件。
通过虚假的雇员信息向真实雇员发放工资问题
部分纳税人在咨询开具完税证明或自助查询申报情况的问题时，系统中会出现很多的扣缴单位申报记录及扣缴税款记录，所记录人员并未在该单位任职受雇。出现这种状况有以下可能性：一是扣缴单位未删除离职人员名单;二是对非法获取的人员信息进行虚假申报，在多列企业所得税费用的同时，将虚假申报的工薪数额用于对其他雇员的工薪发放上。
少记销售收入或是隐匿了一部分销售收入
那么金税三期可通过你的成本和费用来比对你的利润是否为负数，或是比对你开具出去的发票，收到的货款数额以及卖出的商品，或者进一步通过大数据，查询与你交易的下游企业的相关账本数据，比对出异常。
长期零申报
企业设立的核心目的是为了创造价值，长期零申报也就是意味着长期没有收入来源，这对企业的长远发展并没有好处。
其次，企业的营运是有成本费用的，如人员工资、门面租金、水电气费等，如果没有收入来源，谁还会愿意“赔钱赚吆喝”，此举必然引起税局的关注。
另外就是如果长期零申报企业有发票，风险会更大，可能涉及“走逃户”、虚开发票、隐瞒收入等情况。
财务人员应积极学习了解财税新政，避免进入涉税处理误区，降低企业的涉税风险。
企业常见的涉税风险有哪些企业常见的涉税风险有：
公司出资购买房屋、汽车，权利人却写成股东，而不是付出资金的单位;
帐面上列示股东的应收账款或其他应收款;
成本费用中公司费用与股东个人消费混杂在一起不能划分清楚;
按照《个人所得税法》及国家税务总局的有关规定，上述事项视同为股东从公司分得了股利，必须代扣代缴个人所得税，相关费用不得计入公司成本费用，从而给公司带来额外的税负。
外资企业仍按工资总额的一定比例计提应付福利费，且年末帐面保留余额;
未成立工会组织的，仍按工资总额一定比例计提工会经费，支出时也未取得工会组织开具的专用单据。
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涉税风险原因分析：
税收行政执法不规范以及税收政策多变性导致的风险 由于中国目前税务行政执法主体多元，主要包括海关、财政、国税、地税等多个政府部门，各部门之间在税务行政执法上常常重叠。
另外，法律、法规、规章中赋予行政机关过多的自由裁量权，纳税人即使具有较为充分的理由，税务机关也可以利用“税法解释权归税务机关”轻易加以否定，从而使纳税人的税务风险大大增加。
由于中国正处于经济变革时期，为了适应经济发展的需要，税务法规变化过快，朝令夕改，税收政策的变化比较频繁、不够稳定，加之信息传输渠道不畅通，难以让纳税人及时准确掌握。如果企业不及时跟进调整自己的涉税业务，就会使自己的纳税行为由合法转变为不合法，给企业带来税务风险。
参考资料来源：百度百科-税收风险